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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003226`

染色体: Chr01 坐标: 51030576-51033390 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003226`
名称	SmilChr01G003226
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.11-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51030576 - 51033390 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991007`
GeneID	`130991007`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991007`
原始查询	`SmilChr01G003226`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.11-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.11-like
Arabidopsis	`AT2G37900` (AT2G37900) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818366] identity=23.9; qcov=0.837; evalue=1.5e-25; confidence=weak
Rice	`Os03g0823500` (OSJNBb0081B07.12) - identity=24; qcov=0.837; evalue=8.46e-20; confidence=weak
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991007

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057771197.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057771197.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057771197.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771197.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771197.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51030679`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B89,D7,D8
`Chr1:51030679`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B89,D7,D8
`Chr1:51030681`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B89,D7,D8
`Chr1:51030681`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B89,D7,D8
`Chr1:51030694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B66,C39
`Chr1:51030706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,D8
`Chr1:51030747`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B1,B123,B20,B41,C52
`Chr1:51030747`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B1,B123,B20,B41,C52
`Chr1:51030775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	59	A11,A13,A15,A22,A24,A7,B10,B104,B109,B113,B114,B117,B119,B122,B127,B129,B131,B132,B137,B140,B26,B27,B29,B33,B37,B4,B47,B50,B55,B56,B65,B66,B67,B76,B82,B85,B86,B88,B89,B96,C11,C16,C2,C20,C25,C26,C30,C31,C36,C39,C44,C58,C65,C69,C85,D10,D11,D6,D7
`Chr1:51030802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C8
`Chr1:51030820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C8
`Chr1:51030837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771197.1

621 aa

310

621

PTR2

PF00854 PTR2 94-433 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771197.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	94	433	2e-07	31.0	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915214.1
GTACAACTAATTATTATATACATACAAGTATTAAAAAAAGATAAAATAGGAAGAATGTCATAACTATATTCTCAAATTTTGAAATGGAACACTTGTTAATAAACAAGTAAAATAGTAAAATATTAAAATAAGACAATTAAAAATGGGAGGGAGTAGGGCTGCTCCAGTCGCTTTCTTTCAGACAGCAATGAATGCTAGCTTTAAAGAGAGAGAAACTAAAGTCTCGAGTAATTGAGGTAGATTGAAAACAATGTGACCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991007
ATGAGGCACATCCAAGTCCTAGAGTTGTGTCGGGAGAAGTTTGGTTACTACGTGGTCTTCACCCCCTCCATCTTTTTCATCTTAGGACTCATATTGAGCTACAAGTTGGTGGAGAAGACATTTCTGAGCATCTTGATCACGCGTCTCAACGACGCATGGGAGGAGTACGACCTCCGAAGTGCTGTGGTAGTTGTGAATTTGCAAGAAGGAACAAGCGCAGTCCTCGTACCGGTTTTCACTTATGTAGCCGAGGTTTATAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771197.1
MRHIQVLELCREKFGYYVVFTPSIFFILGLILSYKLVEKTFLSILITRLNDAWEEYDLRSAVVVVNLQEGTSAVLVPVFTYVAEVYTGRFLMLFFSTTLCIIGLLLNYVAVGNDDSGQLELQLFYPALGLMTLAEAAQTVTLQAFLDDQFRPMDLGKDRRLGCTKFWWILVSFVAAIFAQFGPLTGFHSRKLALVLMGLMGGCFLVFLLGKKCYHNVLTIQNHPFKQVGNVIARAIANRNLDYTLTTQPRVPWLRWLDRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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