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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003227`

染色体: Chr01 坐标: 51039238-51041256 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003227`
名称	SmilChr01G003227
描述	glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51039238 - 51041256 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009607`
GeneID	`131009607`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009607`
原始查询	`SmilChr01G003227`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 1-like
产物	glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT5G57020` (NMT1) myristoyl-CoA:protein N-myristoyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835805] identity=68.1; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0708100` - identity=64.5; qcov=0.923; evalue=1.34e-161; confidence=high
GO	GO:0004379 (glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0018008 (N-terminal peptidyl-glycine N-myristoylation)
KEGG	-
Pfam	PF01233 (NMT); PF02799 (NMT_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009607

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793008.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793008.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793008.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793008.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793008.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51039456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B53,B78,D11
`Chr1:51039573`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	159	A15,A19,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A3,A5,A6,A8,A9,B1,B102,B104,B105,B107,B108,B110,B112,B113,B114,B115,B118,B120,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B128,B13,B130,B132,B135,B136,B137,B139,B15,B16,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B23,B27,B28,B29,B3,B30,B32,B36,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B48,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B58,B61,B62,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B8,B80,B81,B83,B84,B86,B87,B9,B93,B94,B95,B96,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C21,C22,C23,C24,C27,C28,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C4,C40,C43,C44,C45,C47,C49,C52,C53,C55,C56,C59,C6,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C70,C72,C73,C74,C77,C78,C79,C81,C83,C84,C85,C87,C9,D2,D9
`Chr1:51039645`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	153	A1,A13,A14,A19,A20,A23,A24,A3,A5,A6,A8,A9,B1,B10,B100,B102,B104,B105,B107,B108,B109,B110,B112,B113,B114,B115,B118,B119,B12,B120,B121,B124,B125,B126,B127,B131,B132,B136,B137,B139,B16,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B23,B27,B29,B3,B30,B31,B33,B35,B36,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B50,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B62,B63,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B8,B80,B81,B83,B87,B88,B9,B92,B93,B94,B95,B96,C1,C12,C13,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C23,C24,C27,C28,C29,C33,C34,C35,C39,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C47,C49,C51,C52,C55,C56,C58,C59,C6,C62,C63,C64,C65,C66,C72,C74,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D2,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr1:51039648`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	229	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B104,B105,B106,B107,B108,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B130,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B23,B25,B26,B27,B3,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B49,B5,B50,B51,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C70,C71,C72,C74,C76,C78,C79,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr1:51039735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B12,B75,C22,C35
`Chr1:51039790`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	60	A15,A2,A20,A3,B1,B104,B105,B107,B114,B118,B12,B120,B128,B13,B132,B135,B139,B15,B17,B22,B32,B36,B40,B41,B44,B48,B52,B68,B7,B71,B72,B75,B77,B83,B9,B93,B99,C11,C14,C15,C27,C32,C33,C34,C36,C37,C4,C47,C52,C55,C56,C62,C68,C69,C72,C73,C74,C78,C79,D2
`Chr1:51039865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,B84
`Chr1:51039902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:51039964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr1:51040057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr1:51040254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B102,B51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793008.1

366 aa

183

366

NMT

NMT_C

PF01233 NMT 68-226 aa PF02799 NMT_C 241-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793008.1`	Pfam	`PF01233`	NMT	Domain	68	226	9.2e-67	224.6	Myristoyl-CoA:protein N-myristoyltransferase, N-terminal domain
`XP_057793008.1`	Pfam	`PF02799`	NMT_C	Domain	241	360	1.4e-37	130.0	Myristoyl-CoA:protein N-myristoyltransferase, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937025.1
GTCAAAACTTTCACCTCGACGGTACGACCGTACGAGTATCACGCTCACACTCCCTCCATTCCAAAATCCCCAAATTGAAGAGAGAAGTCATTCTACCGCCGCTGCCTTGCCGTGTATCGTCCCCAGCCTACCTCTTCGCTGCCGCCGTGGTAATCTCCACTCCGCCGTCTACACCCCGTTTCCGCCGCTGCAGTCCCCACTTCGCCGATTCTGCTTGCCGTCACGTTTTTTGAGAATGGCTGACAACGATGCTTCAGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009607
ATGGCTGACAACGATGCTTCAGCCAAAAACATTCCCTCTAACAAGAATAATGCACCTTCGGTGAATGAAATTGAAACGTCCATTGATTCATTGGCAAGAAAGGTTCAAGAGTCCTTCTCACTTAAAAAGAGGCATAAATTTTGGGAGACCCAACCAGTTTGCCAGTTTAAGGATCTTGGAGATACGCGCTTGCCTGAAGGCCCGATTGAGCAACCAACACCGCTGTCTGAAGTCAAGCAAGAGCCATATAATCTTCCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793008.1
MADNDASAKNIPSNKNNAPSVNEIETSIDSLARKVQESFSLKKRHKFWETQPVCQFKDLGDTRLPEGPIEQPTPLSEVKQEPYNLPPPYELVTCDLDSEEVCSEVYTLLTNNYIDYNDNMFRFNYSKEFLRWALRPPGYFRSWHIGLRVKTSKKLVAFITGIPAKIRVRDAVVLLAEVNFLCVHKKLQSRSLAPVMIKELSRRVRLENVWQAAYTAAAVLPTPITTFMFWHRSLNPKKLIDVGFCRLGAWTMSEFINFYK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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