当前解析结果
SmilChr01G003231| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003231 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003231 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003231 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 51081205 - 51081873 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131009620 |
|---|---|
| GeneID | 131009620 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009620 |
| 原始查询 | SmilChr01G003231 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009620 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057793018.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793018.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793018.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057793018.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057793018.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:51081406 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 20 | A18,B10,B102,B103,B136,B138,B31,B54,B55,B57,B58,B83,B98,C18,C46,C49,C51,C59,C80,C9 |
Chr1:51081411 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C17 |
Chr1:51081428 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B56,B76,B96,D7 |
Chr1:51081481 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B89,D11 |
Chr1:51081489 |
CA |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B123,C60 |
Chr1:51081489 |
CA |
C |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B123,C60 |
Chr1:51081493 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B123,C60 |
Chr1:51081499 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B56,B76,B96,D7 |
Chr1:51081546 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B12 |
Chr1:51081651 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B135,B26,C8,D4 |
Chr1:51081654 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B14,C28,C31 |
Chr1:51081662 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B56,B76,B96,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。