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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003256`

染色体: Chr01 坐标: 51262243-51265821 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003256`
名称	SmilChr01G003256
描述	uncharacterized SmilChr01G003256
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51262243 - 51265821 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009639`
GeneID	`131009639`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009639`
原始查询	`SmilChr01G003256`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=28.8; qcov=0.49; evalue=1.37e-57; confidence=low
Rice	`Os09g0545250` - identity=46.8; qcov=0.118; evalue=1.59e-39; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos); PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009639

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057793037.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057793037.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057793037.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793037.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793037.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51262283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B5,B59,C76
`Chr1:51262292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr1:51262294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:51262297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,B38,B70
`Chr1:51262328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C48
`Chr1:51262362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:51262372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:51262375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A3,B135,C31,D11
`Chr1:51262403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr1:51262534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:51262625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:51262626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793037.1

1192 aa

596

1192

Exo_endo_phos

zf-RVT

RVT_3

PF03372 Exo_endo_phos 5-224 aa PF13966 zf-RVT 865-937 aa PF13456 RVT_3 1044-1165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793037.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	5	224	1.5e-07	32.2	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family
`XP_057793037.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	865	937	3.3e-12	47.6	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057793037.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	1044	1165	1.8e-14	54.4	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937054.1
ATGAATTGTATTGTTTGGAATGCCAGGGGGTTGGGGAGCTCCCGAGCATTCCACGAGCTCCGCCGGTTGGTTACTGGCTTCTCCCCAAATTTGCTGTTTATTAGCGAGACCAAGGTCAATACCTTAAAAAGCAATAGGTGGCGAACTAATCTTAATTTTGATGGACAATTCGTCGTTGATTCTAGAGGTGCTAGTGGTGGTTTGATGCTTCTGTGGAAGCAACCTTGTGTGGTCGATATTCGTAGTTATTCTATGGGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009639
ATGAATTGTATTGTTTGGAATGCCAGGGGGTTGGGGAGCTCCCGAGCATTCCACGAGCTCCGCCGGTTGGTTACTGGCTTCTCCCCAAATTTGCTGTTTATTAGCGAGACCAAGGTCAATACCTTAAAAAGCAATAGGTGGCGAACTAATCTTAATTTTGATGGACAATTCGTCGTTGATTCTAGAGGTGCTAGTGGTGGTTTGATGCTTCTGTGGAAGCAACCTTGTGTGGTCGATATTCGTAGTTATTCTATGGGACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793037.1
MNCIVWNARGLGSSRAFHELRRLVTGFSPNLLFISETKVNTLKSNRWRTNLNFDGQFVVDSRGASGGLMLLWKQPCVVDIRSYSMGHIDCIVLFNDIKWRFTGFYGNPETKKRKNSWELLKRLACCGFHDLPWIVGGDCNEILSQKDCCARSRRPWSQMRDFSRTLQFCGLQTLSCEAQFTWFNHRKNEEARSLKLDRFVCNRGAMDVFDFQIVRALDPHMSDHLPLLLKMEKMEDRVESGNGYKRFYFEQKWFVDKTFA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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