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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003258`

染色体: Chr01 坐标: 51287959-51289017 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003258`
名称	SmilChr01G003258
描述	uncharacterized SmilChr01G003258
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51287959 - 51289017 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009646`
GeneID	`131009646`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009646`
原始查询	`SmilChr01G003258`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0278500; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os03g0278500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0278500` - identity=22.7; qcov=0.338; evalue=8.47e-07; confidence=weak
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009646

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057793043.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057793043.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057793043.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057793043.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793043.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51288409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B29,B90
`Chr1:51288409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,B90
`Chr1:51288459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr1:51288462`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C81
`Chr1:51288462`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C81
`Chr1:51288476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B49
`Chr1:51288486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr1:51288509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C81
`Chr1:51288510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C33
`Chr1:51288513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,C81
`Chr1:51288523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,C3,C81,C87
`Chr1:51288541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C3,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793043.1

352 aa

176

352

RRM_1

PF00076 RRM_1 56-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793043.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	56	121	1.3e-06	28.8	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937060.1
ATGGAGCCTAGAGAGAGCGAGAGAGAGTGGAGAGTGGTGAGAAGAAGAGGGATTGGTCCAAAACATGTCGAGAGAAAACAGGCAAGAAGCTGGAATCGGAGCAGTTTGAATGGGAGGAGAGATTGGAGTTCGAATGAACGCGATGACACTACAACCTTTTTCTTTAACAACATCCCAGAGGATTGCAGCCTTGATTTTCTCAGACGTAAGTTCGAGACGGTTGCGAAGACGGTGGATGTTTACTGCCCAAGGAAGAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009646
ATGGAGCCTAGAGAGAGCGAGAGAGAGTGGAGAGTGGTGAGAAGAAGAGGGATTGGTCCAAAACATGTCGAGAGAAAACAGGCAAGAAGCTGGAATCGGAGCAGTTTGAATGGGAGGAGAGATTGGAGTTCGAATGAACGCGATGACACTACAACCTTTTTCTTTAACAACATCCCAGAGGATTGCAGCCTTGATTTTCTCAGACGTAAGTTCGAGACGGTTGCGAAGACGGTGGATGTTTACTGCCCAAGGAAGAGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793043.1
MEPRESEREWRVVRRRGIGPKHVERKQARSWNRSSLNGRRDWSSNERDDTTTFFFNNIPEDCSLDFLRRKFETVAKTVDVYCPRKRDLWGRPFGFVRFEKVERSETLLVDLNKLWIGSYKVKVYKPKFQRDYKPKFERVDEKRRNEQNSVKEKKLEQIQPCTMKVYNRHAGVSFKEALTGAKDDKELDDETLQFQTTEEDLVWLNGAFTGYIKSEFLWEEVREEINSECAGCFKLNSLGGNMVLIQSSNEQTTEENLNKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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