当前解析结果
SmilChr01G003260| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003260 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003260 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003260 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 51297136 - 51297798 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991397 |
|---|---|
| GeneID | 130991397 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991397 |
| 原始查询 | SmilChr01G003260 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991397 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057771576.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057771576.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057771576.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057771576.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771576.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:51297235 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C49,C71 |
Chr1:51297265 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr1:51297291 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,B82 |
Chr1:51297293 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B47,C41,C56 |
Chr1:51297301 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B62,C45 |
Chr1:51297316 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr1:51297348 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B122,B71,C16,C7,D2 |
Chr1:51297349 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 10 | B22,B38,B39,B46,B86,B9,B93,C13,C60,D3 |
Chr1:51297381 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B52,B65 |
Chr1:51297422 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B17 |
Chr1:51297433 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr1:51297449 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B102,B15,C51 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。