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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003262`

染色体: Chr01 坐标: 51319187-51320931 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003262`
名称	SmilChr01G003262
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51319187 - 51320931 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991405`
GeneID	`130991405`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991405`
原始查询	`SmilChr01G003262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9
产物	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9
Arabidopsis	`AT1G55080` (MED9) mediator of RNA polymerase II transcription subunit-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841951] identity=42.5; qcov=1.42; evalue=6.45e-40; confidence=medium
Rice	`Os01g0501000` (OsMED9) - identity=60.9; qcov=0.532; evalue=6.44e-36; confidence=medium
GO	GO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016592 (mediator complex)
KEGG	-
Pfam	PF07544 (Med9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991405

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771604.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057771604.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771604.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771604.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771604.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51319441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:51319596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:51320036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,C25
`Chr1:51320403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771604.1

173 aa

173

Med9

PF07544 Med9 91-165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771604.1`	Pfam	`PF07544`	Med9	Family	91	165	1.3e-07	32.3	RNA polymerase II transcription mediator complex subunit 9

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915621.1
CTTTACCATTGCTGATGCGACACGTGTCCATGAACCAGTGCCTCGCCTTTGGGCCAACGTGGACCTCACAAAATAAAACAAAAGCCCAAATGTCAAAATGCGATTAGGCCCACAAAGAGGGGCAGACGACACCGTTTAGATCTTCTCTCTTTGGAGAAGAAACTTCTGAAGCGGAGAAGAAAAGAAATATGGAGCATTTCGGGGGAGGAGGGAACTGGGCAATGATCCCCAACATCCAGTCCCACAGTAATCCCGCTACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991405
ATGGAGCATTTCGGGGGAGGAGGGAACTGGGCAATGATCCCCAACATCCAGTCCCACAGTAATCCCGCTACTCCTTCCAATCAGGACCATCTATTCCTCCAGCAACAGCAATTCAATCAACAACAACAGTTTCAGCAGCAATTCAACCACCACCAGCAGCCGCCGCTGCGTTTCCAACAGCAACCGCAACAACAAACGACGCCGCCACCGCCGCCGCAGCAGCCACAACAGTCTCTCGCCTCTCATTTTCACCTGCTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771604.1
MEHFGGGGNWAMIPNIQSHSNPATPSNQDHLFLQQQQFNQQQQFQQQFNHHQQPPLRFQQQPQQQTTPPPPPQQPQQSLASHFHLLHLVENLADVTENGTRDQQTDALVAELNTQFEKCQQLLNSIAGTIKTKSTTVEEQKRKLEETENLLCKRRELISEYRNSVEEIINSQI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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