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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003265`

染色体: Chr01 坐标: 51330663-51335242 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003265`
名称	SmilChr01G003265
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51330663 - 51335242 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991428`
GeneID	`130991428`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991428`
原始查询	`SmilChr01G003265`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 4-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 4-like
Arabidopsis	`AT1G76320` (FRS4) FAR1-related sequence 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843965] identity=60.5; qcov=0.929; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0681300` - identity=33.6; qcov=0.812; evalue=2.56e-116; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991428

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771636.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771636.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771636.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771636.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771636.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51331335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B28,B59,C38,C75
`Chr1:51332126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B111,B113,B33,C58
`Chr1:51332232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B94,C8,C80,D6
`Chr1:51332481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B62,B74,C22,C35,C45
`Chr1:51332490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:51332523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,D5
`Chr1:51332549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B62,B74,C22,C35,C45
`Chr1:51333313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:51334404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771636.1

751 aa

376

751

FAR1

MULE

SWIM

PF03101 FAR1 31-116 aa PF10551 MULE 230-323 aa PF04434 SWIM 518-544 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771636.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	31	116	1.9e-28	99.7	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057771636.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	230	323	7.9e-23	81.4	MULE transposase domain
`XP_057771636.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	518	544	4.8e-09	36.3	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915653.1
AAAACGAGGTTTCCAAGAATTATGTGGTCTAAATGAGAATACTAAAGAAAATAGGGACAGATTAAATCAAAATGCGCGCAGCAATTTTCAGAATTTATTTTCTCGAAATTGAAAATCTTCTGACCCTTTTCAATTTACTTGCACCAATTTTTGCCAAAAAATAAATAAATTTCAATCTTTATTTGTATGCAATCAAACGTTGCTCCTCCCAGAACCTTCCACCAGCTGCTGGCAAGCAAGCAAAACATTTTTTGCCAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991428
ATGGAGGCGAGCAGCAGTAGTGTGCTAGTGAATTCGAACTTAGAGCCTAGGGATGATCTTGAATTCGATACACACGAAGCAGCATATGCATATTACAAAGAATACGCGAAATCTGTAGGGTTTGGTACAGCCAAATTGAGCAGTCGTCGCTCAAGGGCTTCAAAAGAATTCATTGATGCCAAATTCTCGTGCATTAGGTATGGGAATAAGCAACAATCAGATGATGCTATTAATCCGAGGCCTTCGCCTAAGATAGGGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771636.1
MEASSSSVLVNSNLEPRDDLEFDTHEAAYAYYKEYAKSVGFGTAKLSSRRSRASKEFIDAKFSCIRYGNKQQSDDAINPRPSPKIGCKASMHVKRRLSGKWYIHSFVKEHNHELLPAQAHFFRSHRIADSVNNDTKVRKKKVPASVLKRYGAYQFVGSCMENVIRNQHDRGRFLSLEEGSAQVLLEFCSHMHEENPKFFYALDFNEEHRLRNVFWVDAKGVEDFTHFGDVVSLDITYFTSKYRVPLVLFVGVNHHIQPTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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