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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003269`

染色体: Chr01 坐标: 51371398-51377146 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003269`
名称	SmilChr01G003269
描述	protein HOTHEAD-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51371398 - 51377146 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991473`
GeneID	`130991473`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991473`
原始查询	`SmilChr01G003269`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein HOTHEAD-like
产物	protein HOTHEAD-like
Arabidopsis	`AT1G72970` (HTH) Glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843628] identity=66.1; qcov=0.94; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0363900` (ONI3) - identity=59.9; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016614 (oxidoreductase activity, acting on CH-OH group of donors); GO:0050660 (flavin adenine dinucleotide binding)
KEGG	smil00073 (Cutin, suberine and wax biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00732 (GMC_oxred_N); PF05199 (GMC_oxred_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991473

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057771711.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057771711.1`
3	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057771711.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771711.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771711.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51371934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:51371972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:51372251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr1:51372258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B80,C6,C63
`Chr1:51372372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B2,C60,C87
`Chr1:51372400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:51372694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr1:51372730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,B60,B66,B98,C48
`Chr1:51372751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,C25,C30,D3
`Chr1:51372847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:51373400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B139,C16,C23
`Chr1:51373430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B43,C54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771711.1

597 aa

298

597

GMC_oxred_N

GMC_oxred_C

PF00732 GMC_oxred_N 65-337 aa PF05199 GMC_oxred_C 433-579 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771711.1`	Pfam	`PF00732`	GMC_oxred_N	Domain	65	337	2.8e-20	73.8	GMC oxidoreductase
`XP_057771711.1`	Pfam	`PF05199`	GMC_oxred_C	Domain	433	579	2.7e-28	100.0	GMC oxidoreductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915728.1
CCATTCATTTCTCCATTAATGCCCTAATTTTTTTTCCTTTTTTCCCAGTTGGATTTCTGTGTCACATTTAAACAAAAGATGCATCATTGTTCATCTTCTGTTGTTTCAAAATTATAAAGCGATCCCAACCAAAAAATAATAATTGTCATAATTATTTATATATAAGTTTACTTACCCCCTTCTGATAAATGCATGCATCATTATCCCTAGCTCAGTCAGTTGAATCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTGCAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991473
ATGGCTTTGGTTGGTGGTGGTGACTGTTCAGTTCTTTACTTGTGCTCACTTGTATGGATCACAACTGTGCTCACTCTCTGTCAAGGTGCTCGAAATGATCATCCTGCTCAATACAAGTACCCCTTCATCAAACCGGCGAGCTCATTCTCATCTCTGCCGTCGTCGGCGGCGTGGGTGGACCCCACGGCGTCGTACGACTACATAGTAGTGGGCGGGGGCACGGCGGGGTGCCCCCTGGCGGCCACCCTATCGCGGAATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771711.1
MALVGGGDCSVLYLCSLVWITTVLTLCQGARNDHPAQYKYPFIKPASSFSSLPSSAAWVDPTASYDYIVVGGGTAGCPLAATLSRNYSVLLLERGGTPFANSNVSFMQNFHITLADFSETSASQMFISTDGVFNSRARVLGGGTGINAGFYSRASSSEIKKAGWDAELVNESYHWVEKQIVHRPDFGPWQRAIRDSLLEIGVSPFHGFTYDHLYGTKVGGTIFDRFGRRHTSAELLASANPEKLRVLVRATVQRIEFDTT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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