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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003270`

染色体: Chr01 坐标: 51392925-51401571 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003270`
名称	SmilChr01G003270
描述	protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51392925 - 51401571 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991481`
GeneID	`130991481`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991481`
原始查询	`SmilChr01G003270`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3-like
产物	protein ROOT HAIR DEFECTIVE 3-like
Arabidopsis	`AT1G72960` (AT1G72960) Root hair defective 3 GTP-binding protein (RHD3) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843627] identity=74.5; qcov=0.965; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0575000` (RHD3) - identity=73.2; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0016320 (endoplasmic reticulum membrane fusion)
KEGG	-
Pfam	PF02263 (GBP); PF05879 (RHD3_GTPase); PF20428 (Sey1_3HB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991481

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057771722.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057771722.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057771722.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057771722.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771722.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51394047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:51395229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B28,B59,C38,C75
`Chr1:51396449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,C35,C5,C62,C82
`Chr1:51396761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,D11
`Chr1:51397451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr1:51398360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:51398722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:51399609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:51399741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B28,B68,C42
`Chr1:51400257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771722.1

793 aa

396

793

GBP

RHD3_GTPase

Sey1_3HB

PF02263 GBP 36-122 aa PF05879 RHD3_GTPase 44-279 aa PF20428 Sey1_3HB 321-756 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771722.1`	Pfam	`PF02263`	GBP	Domain	36	122	4.4e-05	23.5	Guanylate-binding protein, N-terminal domain
`XP_057771722.1`	Pfam	`PF05879`	RHD3_GTPase	Domain	44	279	8.5e-116	386.3	Root hair defective 3 GTP-binding protein (RHD3) GTPase domain
`XP_057771722.1`	Pfam	`PF20428`	Sey1_3HB	Domain	321	756	1.3e-147	492.8	Sey1 three-helix bundle domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915739.1
GATACAACCACTCCTTCATTTTTGGCTATAAAAATATATTTTCTCCCATCAGCAACTTTTTCAAGGCGCAGAGTCACATTTTACACACACAAAATCATGTATGCCTACGAACTAACGCCTATTTAGGATCCTCGCCTTCTTCGCACAATTCTCCGATCTCCCAATCTCCGGCAACTCGCCGTCGTCGACCGGAATTTCTCAATTTGCTCCGCACATGGATAAAAACTGTTGCTCAACTCACCTCATAGATGGGGATGGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991481
ATGGATAAAAACTGTTGCTCAACTCACCTCATAGATGGGGATGGTAATTTCAATGTCGAGGGGGTTGACAATTTCATGAAGGAAGTTAAACTTTCCGAATGTGGGCTTTCTTATGCAGTAGTAGCCATCATGGGCCCTCAGAGTAGCGGGAAGAGTACATTGATGAATCATCTGTTCGGTACCAATTTCAGAGAAATGGATGCTTTTAAGGGAAGGTCCCAAACCACAAAAGGTATATGGATGGCTAGGTGTGTCGGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771722.1
MDKNCCSTHLIDGDGNFNVEGVDNFMKEVKLSECGLSYAVVAIMGPQSSGKSTLMNHLFGTNFREMDAFKGRSQTTKGIWMARCVGMEPCTIVMDLEGTDGRERGEDDTAFEKQSSLFALAVSDIVLINMWCHDIGREQAANKPLLKTVFQVMMRLFSPRKTTLLFVIRDKTRTPLENLEPVLREDIQKIWDSVPKPEAHRETPLSEFFNVEVVALSSFEEKEEQFREQVTSLRKRFHQSIAPGGLAGDRRGVVPASGFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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