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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003297`

染色体: Chr01 坐标: 51655119-51658323 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003297`
名称	SmilChr01G003297
描述	putative disease resistance protein RGA3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51655119 - 51658323 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991781`
GeneID	`130991781`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991781`
原始查询	`SmilChr01G003297`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein RGA3
产物	putative disease resistance protein RGA3
Arabidopsis	`AT3G14470` (AT3G14470) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820670] identity=31.1; qcov=0.939; evalue=1.07e-104; confidence=low
Rice	`Os05g0492200` (YR1) - identity=31.9; qcov=0.988; evalue=1.61e-121; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14); PF25019 (LRR_R13L1-DRL21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991781

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057772162.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057772162.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772162.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772162.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772162.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51655442`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	85	A1,A15,A18,A19,A20,A25,A4,A7,B102,B104,B110,B117,B119,B123,B126,B127,B13,B130,B134,B135,B138,B19,B20,B21,B22,B25,B29,B31,B36,B4,B40,B41,B5,B55,B59,B60,B61,B63,B67,B69,B70,B73,B75,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B84,B86,B87,B88,B90,B92,B93,B97,B99,C12,C18,C26,C27,C28,C3,C32,C4,C40,C44,C49,C50,C52,C56,C57,C6,C61,C62,C63,C67,C68,C7,C70,C71,C84,D2,D3
`Chr1:51655450`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	86	A1,A15,A18,A19,A20,A25,A3,A4,A7,B102,B104,B110,B117,B119,B123,B126,B127,B13,B130,B134,B135,B138,B19,B20,B21,B22,B25,B29,B31,B4,B40,B41,B5,B55,B59,B60,B61,B63,B67,B69,B70,B73,B75,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B84,B86,B87,B88,B90,B92,B93,B97,B99,C12,C18,C26,C27,C28,C3,C32,C4,C40,C44,C49,C5,C50,C52,C56,C57,C6,C61,C62,C63,C67,C68,C7,C70,C71,C84,D2,D3
`Chr1:51655502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B22,B67,B75
`Chr1:51655518`	`T`	`TA`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	6	A19,B102,B119,B29,B67,C30
`Chr1:51655519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	110	A1,A15,A16,A18,A2,A20,A25,A3,A4,A7,B110,B111,B113,B115,B117,B121,B123,B124,B126,B13,B130,B134,B135,B138,B140,B16,B17,B19,B20,B21,B22,B25,B31,B34,B4,B40,B41,B46,B47,B5,B55,B59,B60,B61,B63,B67,B69,B70,B72,B73,B75,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B97,B99,C10,C12,C18,C2,C22,C26,C27,C28,C3,C32,C38,C4,C40,C44,C49,C50,C51,C52,C53,C56,C57,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C67,C68,C7,C71,C78,C82,C84,C86,D1,D10,D11,D2,D3
`Chr1:51655528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr1:51655546`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	114	A1,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A25,A3,A4,A7,B102,B103,B104,B110,B111,B113,B115,B117,B119,B121,B123,B124,B126,B13,B130,B135,B138,B140,B16,B17,B19,B20,B21,B22,B25,B29,B34,B4,B40,B41,B46,B47,B5,B55,B59,B60,B61,B63,B67,B69,B70,B72,B73,B75,B77,B78,B8,B80,B81,B82,B84,B86,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B97,B99,C10,C12,C18,C2,C22,C26,C27,C28,C3,C30,C32,C34,C35,C38,C4,C40,C44,C49,C50,C51,C52,C53,C56,C57,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C67,C68,C7,C71,C78,C82,C84,C86,D1,D10,D11,D2,D3
`Chr1:51655654`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B10,B102,B119,C30
`Chr1:51655654`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B10,B102,B119,C30
`Chr1:51655715`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A11,A24,B120,B22,B24,B58,B60,B69,B7,B93,C33,C40,C48,C53,C57,C74
`Chr1:51655719`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A11,A24,B120,B22,B24,B58,B60,B69,B7,B93,C33,C40,C48,C53,C57,C74
`Chr1:51655780`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772162.1

970 aa

485

970

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

LRR_R13L1-DRL21

PF18052 Rx_N 5-100 aa PF00931 NB-ARC 179-349 aa PF23559 WHD_DRP 436-510 aa PF23598 LRR_14 600-880 aa PF25019 LRR_R13L1-DRL21 722-843 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772162.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	100	4.4e-21	75.5	Rx N-terminal domain
`XP_057772162.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	179	349	1.1e-36	126.7	NB-ARC domain
`XP_057772162.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	436	510	4.4e-19	69.0	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057772162.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	600	880	4.1e-27	95.6	Leucine-rich repeat region
`XP_057772162.1`	Pfam	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	Repeat	722	843	2.4e-26	92.8	R13L1/DRL21 LRRs

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916179.1
ATCAAATTAAGTTATCTTTACTTGGCAAATGGGACTTATTAGATTAATCAGTAATCCGTTGATTTACAACATCATCAACAAAAGCAAAGCAAAGCATAGAAAAGGAGCTCCAAAACACTTAAACATACAAGTAAGAAAACTGCAATAGTGACGATGGCGGATGCTGTTATTTCAGTTGTGGTGGAGAGAGTTGCAGCTATCATTGAAGATCAGATTCGGTACGAGGTCAATTTGGTGAGGGGCGTTGAGAAGGAGGTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991781
ATGGCGGATGCTGTTATTTCAGTTGTGGTGGAGAGAGTTGCAGCTATCATTGAAGATCAGATTCGGTACGAGGTCAATTTGGTGAGGGGCGTTGAGAAGGAGGTTCTGGATCTTTCCGACAAGCTCAACACGATCAAAAATGTGTTGGATGATGCAGAAAAGAGAGGGGTGAAAGAATCAAGCGTCAAAAATTGGTTGAAGAAGTTCGAGGATACGACGTATGAGATGGACGACATTTTGGATGAATGGAACTACGCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772162.1
MADAVISVVVERVAAIIEDQIRYEVNLVRGVEKEVLDLSDKLNTIKNVLDDAEKRGVKESSVKNWLKKFEDTTYEMDDILDEWNYALLEHKIAEAASPKQKVSCSFVPSSCLSFNKVSFRRHTSKKIHNVKAKLDQILKEKDDFNFVMHLPSIDHMPKSGRVQSTSSIDLKKVCGVDIEKNKNDIVRKLRLNGDTQIVSIVGMGGIGKTTLAQLVYNNTQVKNCFGLKIWICVSDPFDVAGIARGIVESVTKQIIPPNNS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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