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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003307`

染色体: Chr01 坐标: 51763182-51768870 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003307`
名称	SmilChr01G003307
描述	uncharacterized SmilChr01G003307
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	51763182 - 51768870 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991862`
GeneID	`130991862`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991862`
原始查询	`SmilChr01G003307`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ubiquitin-conjugating enzyme family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841598]; symbol=AT1G51730; hit=AT1G51730; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ubiquitin-conjugating enzyme family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841598]; symbol=AT1G51730; hit=AT1G51730; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G51730` (AT1G51730) Ubiquitin-conjugating enzyme family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841598] identity=70.6; qcov=1; evalue=2.13e-110; confidence=high
Rice	`Os01g0558300` - identity=67.9; qcov=0.992; evalue=5.39e-105; confidence=high
GO	GO:0002181 (cytoplasmic translation); GO:0005515 (protein binding); GO:0005844 (GO:0005844)
KEGG	-
Pfam	PF05773 (RWD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991862

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772265.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057772265.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057772265.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057772265.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772265.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:51765972`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B35
`Chr1:51765972`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B35
`Chr1:51766529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B113,B33
`Chr1:51767653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr1:51767698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr1:51768317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:51768325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772265.1

245 aa

122

245

RWD

PF05773 RWD 7-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772265.1`	Pfam	`PF05773`	RWD	Domain	7	122	1.4e-24	87.1	RWD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916282.1
AGTTTTGTAATCAGGCACGGCAAGTTGTATATAAGTTTCGCTACACCTGTCCTACATGCATGAAATTTGTTAGAATTCTCATCAAGGAATCTTTTTCAACGGCTCTGATTGATTTCAGATTAATTTGATGTGTGATGTGTGGTGATTAGGGCGCTTTTGTTTGAGGTTCTGTGCAGCTGAGCGCACCTGACCAGAAAGATAGTGTGCGTAGGTCCCACCCGCCTCCTCTGTTCTGATTAGGGTTTTTCTCTCTCTCTAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991862
ATGACAGACTATAAGGCGGAGCAGGACATGGAAATTGAAGCCTTGGAAGCAATCCTTGCGGATGAGTTTAAAGAAATTCATTCTAGTGAAAGTGGTCTGAATACTTCGAATCGTTGCTTTGAGATAACCATCTGTCCCCAGGACGATGAGGCAGATGAGTCAAATTACCTATCAGTACGGCTGGCATTGATATTCTCGCACACAGAAAACTATCCTGATGAACCTCCACTTCTCAATTTTAAAAGTTTGAAAGGAATTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772265.1
MTDYKAEQDMEIEALEAILADEFKEIHSSESGLNTSNRCFEITICPQDDEADESNYLSVRLALIFSHTENYPDEPPLLNFKSLKGIQQGDLRALKEKLEQEAADNLGMAMIYTLVTSAKEWLSERFAQDAGDDDDEEDEAAKDEVIIPHGEPVTVDSFLAWRERFEAELALERAKLMPDSALAAPKEKRLSGRQWFESGRASAKGAAAAAEEDEEIDEDIDFDDDDFEVDEDDMLEHYLAEKTES

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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