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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003333`

染色体: Chr01 坐标: 52032767-52035322 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003333`
名称	SmilChr01G003333
描述	endo-1,4-beta-xylanase 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52032767 - 52035322 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992320`
GeneID	`130992320`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992320`
原始查询	`SmilChr01G003333`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endo-1,4-beta-xylanase 5-like
产物	endo-1%2C4-beta-xylanase 5-like
Arabidopsis	`AT4G33830` (AT4G33830) Glycosyl hydrolase family 10 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829525] identity=43; qcov=0.95; evalue=1.16e-148; confidence=medium
Rice	`Os03g0201500` - identity=41.4; qcov=0.962; evalue=5.98e-146; confidence=medium
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00331 (Glyco_hydro_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992320

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057772886.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057772886.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772886.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772886.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772886.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52032866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C61,C78
`Chr1:52032891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,B70
`Chr1:52032982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C5
`Chr1:52033057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B15
`Chr1:52033338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:52033371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,C79
`Chr1:52033373`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B101,B108,B117,B76,C23
`Chr1:52033373`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B101,B108,B117,B76,C23
`Chr1:52033556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A21,B86,C10,C66,C77
`Chr1:52033556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B86,C10,C66,C77
`Chr1:52033559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,C50,C69
`Chr1:52033618`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B109

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772886.1

575 aa

288

575

Glyco_hydro_10

PF00331 Glyco_hydro_10 224-482 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772886.1`	Pfam	`PF00331`	Glyco_hydro_10	Domain	224	482	1.1e-32	114.3	Glycosyl hydrolase family 10

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916903.1
ATTCTACCTCACCCCTTCAAGCTTTCTTAAACACAATCCTCAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGCCTTGAGATTCCGCCGAAGAAGAATTTGAACTTCCATCGTCCAAATGGCTTTTCTGATCACTGTTTTCACTCTATTCTCTCTTTTCTTTGTTTTTGAAGTTTATGCGGTGCCCTATGATTACTCATACACACTTGGGTGTGTGGCGAAGCCCAAGCCGCCGCAATACTATGGAGGAATCGCCGTGAATTCAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992320
ATGGCTTTTCTGATCACTGTTTTCACTCTATTCTCTCTTTTCTTTGTTTTTGAAGTTTATGCGGTGCCCTATGATTACTCATACACACTTGGGTGTGTGGCGAAGCCCAAGCCGCCGCAATACTATGGAGGAATCGCCGTGAATTCAGAATTCAACGATGAACTTACGGGATGGGCGGCAGTTGGAAACGCTACAATAGCTACTGCCAAGTCGGCGTGCGGCAATAGCTACGCAGTCGTTTCCAACATTCACACGCCACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772886.1
MAFLITVFTLFSLFFVFEVYAVPYDYSYTLGCVAKPKPPQYYGGIAVNSEFNDELTGWAAVGNATIATAKSACGNSYAVVSNIHTPRSDGLSQAFNVDRDILYTVSAWFQVSVGEVAVQVKIVTSTGNQTANWIVAKAGCWTMLKGGFHVNVTEAAELHFETNSTGSDMWVDSVSVQPFTQEEWTCHQAHSLEKVRKGKVRFEVVDPLENPVADAAVLIKQHEPHFPFGCNMNRLILDNQEYQRWFLEKRFKYSAFENEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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