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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003344`

染色体: Chr01 坐标: 52214949-52217148 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003344`
名称	SmilChr01G003344
描述	malonyl-coenzyme:anthocyanin 5-O-glucoside-6'''-O-malonyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52214949 - 52217148 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992572`
GeneID	`130992572`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992572`
原始查询	`SmilChr01G003344`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	malonyl-coenzyme:anthocyanin 5-O-glucoside-6'''-O-malonyltransferase-like
产物	malonyl-coenzyme:anthocyanin 5-O-glucoside-6'''-O-malonyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G03940` (AT1G03940) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839366] identity=31.4; qcov=1.02; evalue=3.81e-68; confidence=low
Rice	`Os02g0820400` - identity=29.3; qcov=1.02; evalue=2.82e-51; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992572

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057773246.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057773246.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773246.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773246.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773246.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52215213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B38,C8
`Chr1:52215235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B17,B67
`Chr1:52215251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B67
`Chr1:52215298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr1:52215966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C57
`Chr1:52216029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B3,C49,C51,D8
`Chr1:52216794`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A3,B104,B16,B54,B58,B91
`Chr1:52216798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C15
`Chr1:52216805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C40
`Chr1:52216865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B125,B13,C22
`Chr1:52216941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B78,C15
`Chr1:52217001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B53,B63,B78,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773246.1

457 aa

228

457

Transferase

PF02458 Transferase 21-450 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773246.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	21	450	1.7e-35	123.2	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917263.1
TATAGCAGCAGAAAATAAAGAGCAAGGCCAATAACTCTATTAGCTAAGTCCAGAACCACCATGACCACCGTGCTTGAAACCTGCGGCATCGCTCCTCCGCCAGGCGCCGCCGCCGAGCTGACGGTGCCGCTTTGCTTCTTCGACATCGTTTGGCTCCATTTCCACCCGATCGACCAGCTCATCTTCTACGACCACCCATGCTCAGAGGAAGAGTTCTCCAAAACCGTCGTTCCAAACCTCAAACACTCTCTCTCTCTAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992572
ATGACCACCGTGCTTGAAACCTGCGGCATCGCTCCTCCGCCAGGCGCCGCCGCCGAGCTGACGGTGCCGCTTTGCTTCTTCGACATCGTTTGGCTCCATTTCCACCCGATCGACCAGCTCATCTTCTACGACCACCCATGCTCAGAGGAAGAGTTCTCCAAAACCGTCGTTCCAAACCTCAAACACTCTCTCTCTCTAACCCTCAAACACTATCTCCCCGTCGCCGCGAATCTCCTCTACCCTCACCACATAGATAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773246.1
MTTVLETCGIAPPPGAAAELTVPLCFFDIVWLHFHPIDQLIFYDHPCSEEEFSKTVVPNLKHSLSLTLKHYLPVAANLLYPHHIDKSQPVIRYVSGDTVPLTVAISGRNFDDLVGSHARESDQFYDFLPPMPPLTEQENYKIAPLVALQVTLFSDRGFCIGLSNNHCLGDARSVVGFMSTWAEINKCGGDKNFMLRNAESLPLIFDRSVFGDISGITDKCWNMMRNIPLAPSSPLLPTNRVRAAFTLHQSDIKKLKNIAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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