当前解析结果
SmilChr01G003345| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003345 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003345 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003345 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 52220336 - 52222111 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993325 |
|---|---|
| GeneID | 130993325 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993325 |
| 原始查询 | SmilChr01G003345 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993325 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057774159.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057774149.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774149.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057774149.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057774149.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:52220514 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B17,B7,C5 |
Chr1:52220514 |
TA |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B17,B7,C5 |
Chr1:52220525 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr1:52221674 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B78 |
Chr1:52221690 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B42 |
Chr1:52221794 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B42 |
Chr1:52221794 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B42 |
Chr1:52221866 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A9,C46,C74 |
Chr1:52221886 |
AGG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C29 |
Chr1:52221886 |
AGG |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | C29 |
Chr1:52221909 |
GA |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 16 | B112,B125,B36,B38,B39,B43,B91,B94,C12,C46,C60,C68,C74,C79,C81,D11 |
Chr1:52221912 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。