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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003351`

染色体: Chr01 坐标: 52261010-52264693 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003351`
名称	SmilChr01G003351
描述	chaperone protein dnaJ 10-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52261010 - 52264693 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992805`
GeneID	`130992805`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992805`
原始查询	`SmilChr01G003351`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperone protein dnaJ 10-like
产物	chaperone protein dnaJ 10-like
Arabidopsis	`AT1G77020` (AT1G77020) DNAJ heat shock N-terminal domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844038] identity=67.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0555700` (OsDjC19) - identity=65.9; qcov=0.995; evalue=4.44e-177; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF14308 (DnaJ-X)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992805

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057773539.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.40000	`XP_057773539.1`
3	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.40000	`XP_057773539.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057773539.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773539.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52261558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C46
`Chr1:52262642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,C87
`Chr1:52262663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B69,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773539.1

383 aa

192

383

DnaJ

DnaJ-X

PF00226 DnaJ 6-68 aa PF14308 DnaJ-X 131-320 aa

XP_057773547.1

377 aa

188

377

DnaJ

DnaJ-X

PF00226 DnaJ 6-68 aa PF14308 DnaJ-X 131-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773539.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	6	68	3.4e-24	85.4	DnaJ domain
`XP_057773539.1`	Pfam	`PF14308`	DnaJ-X	Domain	131	320	2.3e-48	165.1	X-domain of DnaJ-containing
`XP_057773547.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	6	68	3.3e-24	85.5	DnaJ domain
`XP_057773547.1`	Pfam	`PF14308`	DnaJ-X	Domain	131	320	4.5e-49	167.4	X-domain of DnaJ-containing

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917564.1
CAATGGACAACGCATCGAAAATGATCAGCGCCACAAAGTGACAGTTAAAATACTGTTTTCCTCCCGCGAAAAAGCTTTTACAAAAAGTGACTTCATTACCTGGCTTTATTCAACTGGAAAGCCCCAACTCCAACATGCCCACACCTCCCCCTATTTTTTTTCACGCTACTTTTCTTCGTCTGCTCTCCTCTCTGCTCCAAGATCACACTTTCTCCATATTCTCTGCAAAAAATGGTTAAAGAAACTGAATTCTACGATAT...

XM_057917556.1
CAATGGACAACGCATCGAAAATGATCAGCGCCACAAAGTGACAGTTAAAATACTGTTTTCCTCCCGCGAAAAAGCTTTTACAAAAAGTGACTTCATTACCTGGCTTTATTCAACTGGAAAGCCCCAACTCCAACATGCCCACACCTCCCCCTATTTTTTTTCACGCTACTTTTCTTCGTCTGCTCTCCTCTCTGCTCCAAGATCACACTTTCTCCATATTCTCTGCAAAAAATGGTTAAAGAAACTGAATTCTACGATAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992805
ATGGTTAAAGAAACTGAATTCTACGATATTCTCGGCGTCAGCCCCGCGGCATCAGAGGAGGAAATTCGCAAGGCCTACTATCTTAAGGCGAGGCAAGTTCACCCCGATAAGAATCCAGACGATTCCCAGGCAGCTGCCCGATTTCAGGTGCTAGGAGAAGCTTACCAAGTTCTGAGTGATCCATTGCAGAGAGATACATATGATCAGAATGGGAAGAATTGCATATCTAAGGAGACAATGCTCGATCCAACTGCTGTCTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773539.1
MVKETEFYDILGVSPAASEEEIRKAYYLKARQVHPDKNPDDSQAAARFQVLGEAYQVLSDPLQRDTYDQNGKNCISKETMLDPTAVFALLFGSELFEDYIGHIAVASMASSELAGEGDNPEKVHDKLKAVQREREEKLAAKLRDFLQQHVGGDRDGFIRKAESEAERLSHASFGSEMLNTIGYIYTRQAALQLGKKAIYLGVPFVAEWVRNKGHFWKSQFTASKGAFQLLQLQDDIRRQCKIEGSGEEDDVEAHLRQNRE...

XP_057773547.1
MVKETEFYDILGVSPAASEEEIRKAYYLKARQVHPDKNPDDSQAAARFQVLGEAYQVLSDPLQRDTYDQNGKNCISKETMLDPTAVFALLFGSELFEDYIGHIAVASMASSELAGEGDNPEKVHDKLKAVQREREEKLAAKLRDFLQQHVGGDRDGFIRKAESEAERLSHASFGSEMLNTIGYIYTRQAALQLGKKAIYLGVPFVAEWVRNKGHFWKSQFTASKGAFQLLQLQDDIRRQCKIEGSGEEDDVEAHLRQNRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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