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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003358`

染色体: Chr01 坐标: 52320655-52323658 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003358`
名称	SmilChr01G003358
描述	scarecrow-like protein 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52320655 - 52323658 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992399`
GeneID	`130992399`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992399`
原始查询	`SmilChr01G003358`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	scarecrow-like protein 1
产物	scarecrow-like protein 1
Arabidopsis	`AT1G21450` (SCL1) SCARECROW-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838743] identity=55.6; qcov=1.12; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0881500` (SCL1) - identity=55.7; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992399

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773002.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057773002.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773002.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773002.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773002.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52321899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B130,B14,B21,B8
`Chr1:52321907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B130,B14,B21,B8
`Chr1:52322297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B44,B50,B53,B71,D5
`Chr1:52322892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr1:52323243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr1:52323420`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A15,B126,B65
`Chr1:52323420`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A15,B126,B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773002.1

524 aa

262

524

GRAS

PF03514 GRAS 155-524 aa

XP_057773010.1

524 aa

262

524

GRAS

PF03514 GRAS 155-524 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773002.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	155	524	2.1e-134	448.8	GRAS domain family
`XP_057773010.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	155	524	2.1e-134	448.8	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917027.1
GCGATGATTGATTGAAGGAAAATGGAGGTGGGGTCGTCTCTTTGACTCAGTGGGTCCACGCCGAGTTTGGTAGACAGAAAACCAGCAACGATAAATAATCAATCAAAGTTGCAGAAGTTTCTATCACATAATTAAAGGGAGATAGGAATGACAGTGGAATCCTAACACGGCCTTGCTGAAGTAGACGCTGTAACTCTCTTTCTTGCTTCGTTTGTTTGAACCAAGAGTTGAACATGTCTTTGGTCGGATCTGCCGCGCTG...

XM_057917019.1
TATCATTTGATAATTCTTCAGGCTCTTCGCTTCACTAATTTCTTGCTGCTTCTTTTCAACATTTTTACAATTTATAATTGATATTTCTTGCTTGGACTTTTGATTTTGTCTGTTTGTTGCTTCTCCACCAACTAAACCTCAAAATCTACGAATTTTGCATAGTTAAAAGGTTATTTAATCCCATCTGCTTCAAAGACTACCTTGTTTTTGTCTGTGTCAAAACCCCTCAAATCCAATTCTGAGCTGATTTTTTTAATTTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992399
ATGTCTTTGGTCGGATCTGCCGCGCTGTTTAGGAGCCCTGAGCCGTATTCGTTGAAAGATGACAACGATAGCTCGGGGCTATCAACATCTGGTTTTTATTCGTACAGCAGTGACAGTTACGATCCAAAGTATTTCCTCGACTCACCATCTAGTTCTGATGTGTTAGGCCACCAGATTCAGTCCTCGTCTTCTCAGCATAGTTCTGGTGAAAATCCATTCCAATCCTCGTTAGGGTTCGATTACGCCTCTGAATTGGATAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773002.1
MSLVGSAALFRSPEPYSLKDDNDSSGLSTSGFYSYSSDSYDPKYFLDSPSSSDVLGHQIQSSSSQHSSGENPFQSSLGFDYASELDSPRNIDYDEDKLNLKLQELEKALLDDNAATMEIDGDFLDSPKESSSSDSNLSSTTSGKEMVISGPLSRKHMLFECAAVVHNGDFKRASSMISVLRQHVSIQGDPSERIAAYMVEALVARIAASGRGLYRALKCKEAPSSDRLSAMQVLFEVCPCFRFGFMAANGAILEAFRDEK...

XP_057773010.1
MSLVGSAALFRSPEPYSLKDDNDSSGLSTSGFYSYSSDSYDPKYFLDSPSSSDVLGHQIQSSSSQHSSGENPFQSSLGFDYASELDSPRNIDYDEDKLNLKLQELEKALLDDNAATMEIDGDFLDSPKESSSSDSNLSSTTSGKEMVISGPLSRKHMLFECAAVVHNGDFKRASSMISVLRQHVSIQGDPSERIAAYMVEALVARIAASGRGLYRALKCKEAPSSDRLSAMQVLFEVCPCFRFGFMAANGAILEAFRDEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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