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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003366`

染色体: Chr01 坐标: 52401490-52403107 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003366`
名称	SmilChr01G003366
描述	uncharacterized SmilChr01G003366
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52401490 - 52403107 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009825`
GeneID	`131009825`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009825`
原始查询	`SmilChr01G003366`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009825

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793214.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793214.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793214.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793214.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793214.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52401637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr1:52401653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B55,B74,C30,C44
`Chr1:52401658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C66
`Chr1:52401693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B14,B5,C36,C50
`Chr1:52401694`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B123
`Chr1:52401694`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B123
`Chr1:52401699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,C43,C78
`Chr1:52401701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B10,B103,B3,B35,B41,B88
`Chr1:52401714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:52401732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B75,B89,C38
`Chr1:52401738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B43,C38,C56,C63
`Chr1:52401743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B64,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793214.1

386 aa

193

386

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 161-300 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793214.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	161	300	5.7e-24	85.6	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937231.1
ATGGTGGGAGGAGGTTCTAGTGCGAGAGGAGGTTCTAGTGGTAGGGGTGCTGCATCATCCGCAGGACACCCTACATCATCCACAGGATCAGATGGAGGGATTGCTGCATCTGTACGGGATATACAGCTGACTCATTCACCTTCATCTTCGGCATCGGTCCCTACTGAGGCATCAGAGGCTACACAGACTGGACGTACTACACTCATCATCAAATATGGGAAATTACATCCCTTGGGGATGGTTCCATCCGTAGTCACTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009825
ATGGTGGGAGGAGGTTCTAGTGCGAGAGGAGGTTCTAGTGGTAGGGGTGCTGCATCATCCGCAGGACACCCTACATCATCCACAGGATCAGATGGAGGGATTGCTGCATCTGTACGGGATATACAGCTGACTCATTCACCTTCATCTTCGGCATCGGTCCCTACTGAGGCATCAGAGGCTACACAGACTGGACGTACTACACTCATCATCAAATATGGGAAATTACATCCCTTGGGGATGGTTCCATCCGTAGTCACTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793214.1
MVGGGSSARGGSSGRGAASSAGHPTSSTGSDGGIAASVRDIQLTHSPSSSASVPTEASEATQTGRTTLIIKYGKLHPLGMVPSVVTKIFKQVQNPEGYSWKLTPLSVKTAYFEEFKKHFTWDAAIESAVYKLWHACAARRYSDFVHDIKERRSKRPPFIHEDHWPNWNKYWDSDEVKAKSEIAKKCRMSEPLGPGTGQAKHKGGSRSILQYAEEVGKRKGVEPTECLYDAYEILHKNKDGTYTDERSRRIGEKVQDIVVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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