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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003370`

染色体: Chr01 坐标: 52428001-52432420 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003370`
名称	SmilChr01G003370
描述	uncharacterized SmilChr01G003370
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52428001 - 52432420 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009838`
GeneID	`131009838`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009838`
原始查询	`SmilChr01G003370`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48); PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009838

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793228.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057793228.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057793228.1`
4	PML body	PML body	0.20000	`XP_057793228.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057793228.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52430958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C45
`Chr1:52431003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr1:52431022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B64
`Chr1:52431039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr1:52431088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:52431089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr1:52431120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:52431137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A10,B127,C1,C66
`Chr1:52431137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B127,C1,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793228.1

972 aa

486

972

DUF8566

DUF1985

Peptidase_C48

PF29561 DUF8566 59-236 aa PF09331 DUF1985 81-215 aa PF02902 Peptidase_C48 821-961 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793228.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	59	236	3e-08	34.4	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057793228.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	81	215	1.9e-11	44.8	Domain of unknown function (DUF1985)
`XP_057793228.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	821	961	1.6e-05	25.6	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937245.1
ATGGCATCTTCTTCACAGGCGAATGTCCCATATCTTCGTCGCGACACTATAGACCAGACGGAGGTTGCTATCAGCACCTACTATAGGGATTCACATTTTCCGGAGCTGGTTGAAACTTTAAATGTGGTCGGCGAACAGTGCAATTCAGATTTATTGGGAAGATTTAGAGCATCATGTTTTGGGCATTTCACTGATTGGAGGCCCGGCGCGAAGAGCAATAAAGCATTACACCAGATTGTATCGAGGCAGATTGTGTCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009838
ATGGCATCTTCTTCACAGGCGAATGTCCCATATCTTCGTCGCGACACTATAGACCAGACGGAGGTTGCTATCAGCACCTACTATAGGGATTCACATTTTCCGGAGCTGGTTGAAACTTTAAATGTGGTCGGCGAACAGTGCAATTCAGATTTATTGGGAAGATTTAGAGCATCATGTTTTGGGCATTTCACTGATTGGAGGCCCGGCGCGAAGAGCAATAAAGCATTACACCAGATTGTATCGAGGCAGATTGTGTCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793228.1
MASSSQANVPYLRRDTIDQTEVAISTYYRDSHFPELVETLNVVGEQCNSDLLGRFRASCFGHFTDWRPGAKSNKALHQIVSRQIVSEENEMCFFLCGARVRFSPADYALVTGLNFGGSRFDATLQHDCSRVEAYRRFCGARSMTIQSLIKRVCDLDRRVDDEDGSLYLRAVLVCVAHTLVLGLDARVQPWLWVLVDDLAAFDRFPWGAYSYKMLCHYTRETGKGEKYHFYGPSWALYVWALERVPGFGHMVAASSGDPTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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