当前解析结果
SmilChr01G003371| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003371 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003371 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003371 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 52432451 - 52434854 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009844 |
|---|---|
| GeneID | 131009844 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009844 |
| 原始查询 | SmilChr01G003371 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | AT1G06740 (MUG3)MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=21.6; qcov=0.878; evalue=9.55e-35; confidence=weak |
| Rice | Os01g0595300- identity=23.8; qcov=0.89; evalue=2.14e-40; confidence=weak |
| GO | GO:0008270 (zinc ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009844 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057793234.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793234.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793234.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057793234.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057793234.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057793234.1PF10551
MULE 272-346 aa
PF00872
Transposase_mut 272-421 aa
PF04434
SWIM 497-527 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057793234.1 |
Pfam | PF10551 |
MULE | Domain | 272 | 346 | 1.8e-12 | 48.2 | MULE transposase domain |
XP_057793234.1 |
Pfam | PF00872 |
Transposase_mut | Family | 272 | 421 | 5.8e-10 | 39.3 | Transposase, Mutator family |
XP_057793234.1 |
Pfam | PF04434 |
SWIM | Domain | 497 | 527 | 4.3e-07 | 30.0 | SWIM zinc finger |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。