当前解析结果
SmilChr01G003375| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003375 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003375 |
| 描述 | maltose excess protein 1-like, chloroplastic |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 52444309 - 52448655 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130992743 |
|---|---|
| GeneID | 130992743 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992743 |
| 原始查询 | SmilChr01G003375 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | maltose excess protein 1-like, chloroplastic |
| 产物 | maltose excess protein 1-like%2C chloroplastic |
| Arabidopsis | AT5G17520 (RCP1)root cap 1 (RCP1) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831618] identity=59.6; qcov=0.878; evalue=6.11e-148; confidence=high |
| Rice | Os04g0602400 (OsMT)- identity=67.7; qcov=0.787; evalue=5.01e-142; confidence=high |
| GO | GO:0005363 (maltose transmembrane transporter activity); GO:0009941 (chloroplast envelope) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF28566 (MEX1_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992743 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057773466.1 |
| 2 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 1.00000 | XP_057773466.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057773466.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057773466.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057773466.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:52445616 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B123,B69,B82 |
Chr1:52445974 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A14,B28,B59,C75 |
Chr1:52446992 |
TAC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B121 |
Chr1:52446992 |
TAC |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B121 |
Chr1:52447359 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C20 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057773466.1PF28566
MEX1_N 91-216 aa
XP_057773475.1PF28566
MEX1_N 91-216 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057773466.1 |
Pfam | PF28566 |
MEX1_N | Domain | 91 | 216 | 9.3e-62 | 207.1 | Maltose excess protein 1 N-terminal domain |
XP_057773475.1 |
Pfam | PF28566 |
MEX1_N | Domain | 91 | 216 | 9.3e-62 | 207.1 | Maltose excess protein 1 N-terminal domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。