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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003380`

染色体: Chr01 坐标: 52489560-52494862 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003380`
名称	SmilChr01G003380
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 45 homolog
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52489560 - 52494862 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992298`
GeneID	`130992298`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992298`
原始查询	`SmilChr01G003380`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 45 homolog
产物	vacuolar protein sorting-associated protein 45 homolog
Arabidopsis	`AT1G77140` (VPS45) vacuolar protein sorting 45 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844050] identity=80.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0437800` (OJ1287_H05.17-2) - identity=75.4; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00995 (Sec1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992298

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057772853.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057772853.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057772860.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057772853.1`
5	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057772853.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52491764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:52493057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:52494289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B4,C36
`Chr1:52494472`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B112
`Chr1:52494472`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B112

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772853.1

575 aa

288

575

Sec1

PF00995 Sec1 22-550 aa

XP_057772860.1

568 aa

284

568

Sec1

PF00995 Sec1 22-552 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772853.1`	Pfam	`PF00995`	Sec1	Family	22	550	1.2e-128	431.5	Sec1 family
`XP_057772860.1`	Pfam	`PF00995`	Sec1	Family	22	552	4.7e-130	436.2	Sec1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916877.1
AAAGAATTAGATATCAAGAATTATCTTTCAATTTTGGCCACTTGGTTTTTAATCATAAGAACCCGGTCCGAGCTACCAGCTGACCAAACGACGGCGTACACGACAATTTCCTCCCCGTTTCTCTTCGCCTTGATCTACCTCCTTCGACTACCTCTCTTAATTTTTCTTCTTCTGCAATTCTTAAACCCCAATCAAAGATTGGGCAAACAAACTGATCAGATCGATAATCCCAACTGTATTGCTGGAAAAGAAAAAAAAAA...

XM_057916870.1
TTATCTTTCAATTTTGGCCACTTGGTTTTTAATCATAAGAACCCGGTCCGAGCTACCAGCTGACCAAACGACGGCGTACACGACAATTTCCTCCCCGTTTCTCTTCGCCTTGATCTACCTCCTTCGACTACCTCTCTTAATTTTTCTTCTTCTGCAATTCTTAAACCCCAATCAAAGATTGGGCAAACAAACTGATCAGATCGATAATCCCAACTGTATTGCTGGAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAATGGTTCTGATTAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992298
ATGGTTCTGATTACGGTCGTACGGGATTACATAAATCGAATGTTACATGACATTTCCGGCATGAAAGTTCTCATCCTCGACTCTCAAACGGTTAGTGTCGTGAGTGTTGTATATTCACAATCGGAGCTGCTTCAGAAAGAAGTATTTTTGGTGGAACTTGTAGATTCCATTTCGATGTCGAAAGAACCCATGTCGCACCTGAAAGCTGTTTATTTTCTCCGTCCAACATCTGAGAATGTTGTTCTTGTGAGACGTCAGCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772853.1
MVLITVVRDYINRMLHDISGMKVLILDSQTVSVVSVVYSQSELLQKEVFLVELVDSISMSKEPMSHLKAVYFLRPTSENVVLVRRQLNHPRFGEYHLFFSNMLKDTQLHNLADADEHEIVQQVQEFYADFVALDSHHFSLNIPSNHMYMLPAVVDPSGLQHFCDQVIDGIAAIFLALKRRPVIRYSRTSDIAKRIAQEALKLMYQQESGLFDFRRSEVSPLLLILDRRDDPVTPLLNQWTYQAMVHELIGIQDNTVDLRN...

XP_057772860.1
MVLITVVRDYINRMLHDISGMKVLILDSQTVSVVSVVYSQSELLQKEVFLVELVDSISMSKEPMSHLKAVYFLRPTSENVVLVRRQLNHPRFGEYHLFFSNMLKDTQLHNLADADEHEIVQQVQEFYADFVALDSHHFSLNIPSNHMYMLPAVVDPSGLQHFCDQVIDGIAAIFLALKRRPVIRYSRTSDIAKRIAQEALKLMYQQESGLFDFRRSEVSPLLLILDRRDDPVTPLLNQWTYQAMVHELIGIQDNTVDLRN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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