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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003386`

染色体: Chr01 坐标: 52539216-52540274 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003386`
名称	SmilChr01G003386
描述	dof zinc finger protein DOF3.1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52539216 - 52540274 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993128`
GeneID	`130993128`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993128`
原始查询	`SmilChr01G003386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dof zinc finger protein DOF3.1-like
产物	dof zinc finger protein DOF3.1-like
Arabidopsis	`AT1G21340` (AT1G21340) Dof-type zinc finger DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838733] identity=62.2; qcov=0.438; evalue=1.07e-33; confidence=low
Rice	`Os01g0865800` (OsDof1) - identity=89.7; qcov=0.259; evalue=1.95e-32; confidence=weak
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02701 (Zn_ribbon_Dof)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993128

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773880.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773880.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773880.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773880.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773880.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52539638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:52539733`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B26
`Chr1:52539733`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B26
`Chr1:52539736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr1:52539782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr1:52539829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:52539831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:52539934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B80,C6
`Chr1:52539946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:52539951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B66
`Chr1:52540030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:52540117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773880.1

224 aa

112

224

Zn_ribbon_Dof

PF02701 Zn_ribbon_Dof 43-97 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773880.1`	Pfam	`PF02701`	Zn_ribbon_Dof	Family	43	97	2.3e-32	111.7	Dof domain, zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917897.1
CTCTCAAAAATATATAGCAACCCCACACCCCACAAATTCCAAAATCACAAACCTTCCTCCATCCATCATCTTCTTCTTCCACAAACTCATCTTACAACAACATGTCATCATCAAGTAACAACCACCCATTTCTTGATCATCAATTCCCCCAAATCAAGCCCTCATTGCTAATGATGGGAAGCTGCAAAACCCTAAAATGGAAGCCCTACTCCGCCATTGAAGCAGCTCCGAGCTGCCCTCGATGCCTCTCCTCCAACACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993128
ATGTCATCATCAAGTAACAACCACCCATTTCTTGATCATCAATTCCCCCAAATCAAGCCCTCATTGCTAATGATGGGAAGCTGCAAAACCCTAAAATGGAAGCCCTACTCCGCCATTGAAGCAGCTCCGAGCTGCCCTCGATGCCTCTCCTCCAACACCAAATTCTGCTACTACAACAACTACAGCGTCTCCCAGCCTCGCTACTTCTGCAAGGCCTGCCGCCGCTACTGGACCAAGGGCGGCTCCCTCCGCAACGTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773880.1
MSSSSNNHPFLDHQFPQIKPSLLMMGSCKTLKWKPYSAIEAAPSCPRCLSSNTKFCYYNNYSVSQPRYFCKACRRYWTKGGSLRNVPVGGGCRKTRRSSRALSRRPPPSESLANAAAPPKHDDYEGSNFAAAEMFECGGDVGVINGGQVHGSFDGGDFVCENFGVFEVEGIGIESEMFPNLEGFGCGQPPLMEMQEFEVFSSGDDHSLMTDNWGSFDLSAYENF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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