当前解析结果
SmilChr01G003392| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003392 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003392 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003392 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 52644354 - 52644785 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131009876 |
|---|---|
| GeneID | 131009876 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131009876 |
| 原始查询 | SmilChr01G003392 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131009876 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057793265.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.20000 | XP_057793265.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057793265.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057793265.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057793265.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:52644359 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B125,B90,B92 |
Chr1:52644369 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B105,B118,B68,B84,C42 |
Chr1:52644423 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C19,C7 |
Chr1:52644551 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B125,B90,B92 |
Chr1:52644633 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C7 |
Chr1:52644633 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C7 |
Chr1:52644643 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B31,B66,B98,C79 |
Chr1:52644656 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B77,B99,C26 |
Chr1:52644664 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C80 |
Chr1:52644730 |
GCC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B118,B90,B97,C43,D11 |
Chr1:52644730 |
GCC |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 5 | B118,B90,B97,C43,D11 |
Chr1:52644735 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B67 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。