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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003396`

染色体: Chr01 坐标: 52671829-52675083 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003396`
名称	SmilChr01G003396
描述	uncharacterized SmilChr01G003396
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52671829 - 52675083 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992582`
GeneID	`130992582`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992582`
原始查询	`SmilChr01G003396`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin interaction motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840956]; symbol=AT1G43690; hit=AT1G43690; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ubiquitin interaction motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840956]; symbol=AT1G43690; hit=AT1G43690; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G43690` (AT1G43690) ubiquitin interaction motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840956] identity=63; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0421800` - identity=69.1; qcov=0.662; evalue=5.75e-148; confidence=high
GO	GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0071108 (protein K48-linked deubiquitination); GO:1990380 (K48-linked deubiquitinase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13898 (MINDY-3_4_CD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992582

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057773257.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057773257.1`
3	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057773257.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773257.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773257.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52673653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr1:52674399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B24,C58
`Chr1:52674537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773257.1

455 aa

228

455

MINDY-3_4_CD

PF13898 MINDY-3_4_CD 1-264 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773257.1`	Pfam	`PF13898`	MINDY-3_4_CD	Domain	1	264	5.4e-49	167.7	Deubiquitinating enzyme MINDY-3/4, conserved domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917274.1
AAAAAATCTGTTTTCCTTACACAACTTCAATTTTGGGATTCAGTCATGCTGCGTCGTATTGAGTGTTATGATATGGGATGGGCCATGCATGCCAAAAAACCTGTATGAAGTAATATATTCCATTTTGTAAGGTTTCGTGTTAGAACCTCAGAACCTACATATTTTTTTTCCTCTATGGTATTCTTTTGGTAAAGATGGAAGCTATGGTTGAGAGTTATCTGGAAGCTATGGGTTGAGAGTTATCACCGTATATAATACTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992582
ATGCAGGCATTTGTACTTAAGCATCTCCTGTTTTCTCCAGAAGAAGCTGTTACTGTTGCACCGAATATGTCAAATTTGTCTATGAGAAGACCGCCCATGAATGAATCTGTTGCTGCAGATATTTTCTCATCACTTTCGGAAGAGAAAAAGTCAAGAGCCTTGGTGAGGAGTATGAGTGAGATACTCTTTCTATGTGGGCGTAGTGAAAGAGCCGTGATAGTGTCTCTGAATATTGTCGGCAGTGATTCTATGAAGTCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773257.1
MQAFVLKHLLFSPEEAVTVAPNMSNLSMRRPPMNESVAADIFSSLSEEKKSRALVRSMSEILFLCGRSERAVIVSLNIVGSDSMKSVNRSEDEVIAEVLGGLSVESGADLQKVLRVDTCTSWSTANKRLEAMLPIFRSRMGALLFLISALLSRGLDNVQEDRDDPTQPLVTAPFGHASQEIVNLLLSGCAVPNVFDGKIDLGGGMFVKGLSTPVEVGFLTLLESLNYCKVGQYLKCPKWPIWVVGSESHYTVLFALDTKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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