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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003402`

染色体: Chr01 坐标: 52710974-52712294 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003402`
名称	SmilChr01G003402
描述	uncharacterized SmilChr01G003402
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52710974 - 52712294 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993303`
GeneID	`130993303`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993303`
原始查询	`SmilChr01G003402`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827347]; symbol=AT4G16490; hit=AT4G16490; species=arabidopsis; confidence=low
产物	ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827347]; symbol=AT4G16490; hit=AT4G16490; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G16490` (AT4G16490) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827347] identity=54.5; qcov=0.407; evalue=5.38e-09; confidence=low
Rice	`Os07g0584900` (OJ1060_D03.106) - identity=54; qcov=0.37; evalue=2.11e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993303

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057774127.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057774127.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774127.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774127.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774127.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52711159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr1:52711211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C41
`Chr1:52711218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr1:52711646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:52711662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:52711685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr1:52711722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr1:52711726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr1:52711774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B25
`Chr1:52711780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B59
`Chr1:52711810`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B25
`Chr1:52711810`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091625.1
TTCAAGGTCCTATGTGGCTTCCTAAGAATTCAGTATTTCAAATCCCTTCAATTTTAGAGCATTTGAGTTTATAATAACTGTTTGAGATTCCTGCTCCCCCCTTAATTCAAGGTTCTATGTGGCTTCCTAATAATTCAGTATTTCAATTCCCTTTAATTCTAAAGCATTTGAGTTTATTATATTCATCCTACGTGGCAATTAATTCCACATAATTTTTTTAATTTTATAAACGCAAAATCAATATTTCTCTCCCCCAATTC...

XR_009091631.1
TTCAAGGTCCTATGTGGCTTCCTAAGAATTCAGTATTTCAAATCCCTTCAATTTTAGAGCATTTGAGTTTATAATAACTGTTTGAGATTCCTGCTCCCCCCTTAATTCAAGGTTCTATGTGGCTTCCTAATAATTCAGTATTTCAATTCCCTTTAATTCTAAAGCATTTGAGTTTATTATATTCATCCTACGTGGCAATTAATTCCACATAATTTTTTTAATTTTATAAACGCAAAATCAATATTTCTCTCCCCCAATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993303
ATGATACGCCGCACTCCGGCCTTAAGTCGGTGCCGCCGCCCCACCCTCCAGTACGGTTGGTCTGCAATGTACCGAAGTTGGCACCATCGCCCCTTCCCTCTATTCCCTTTCTTTAACCTTCTCCTCGATCCTATTCGGCGCCGGTTCCTCGTCGTTGCTGTCGCAATCCCTCTGTCAGTTTCTCTTTGCCGGCCGCCACTAATGGCTGGCCCGCTGCATCTCCACTCAATCCTCGGCACTCCTCCAACAATAGAGGCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774127.1
MIRRTPALSRCRRPTLQYGWSAMYRSWHHRPFPLFPFFNLLLDPIRRRFLVVAVAIPLSVSLCRPPLMAGPLHLHSILGTPPTIEALNYSRSRRKKKTMVVLSSLATIEIGQDAIEEGGITTLVETIEDGSNKGK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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