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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003405`

染色体: Chr01 坐标: 52721666-52724599 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003405`
名称	SmilChr01G003405
描述	receptor-like protein EIX1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52721666 - 52724599 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009885`
GeneID	`131009885`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009885`
原始查询	`SmilChr01G003405`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein EIX1
产物	receptor-like protein EIX1
Arabidopsis	`AT2G34930` (AT2G34930) disease resistance family protein / LRR family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818058] identity=35.3; qcov=0.974; evalue=2.9e-151; confidence=medium
Rice	`Os01g0601675` - identity=38.2; qcov=0.997; evalue=1.69e-178; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009885

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057793274.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793274.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793274.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793274.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793274.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52721771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	B107,B120,B128,B22,B29,B3,B4,B67,B7,B72,B89,C29,C30,C31,C34,C47,C86
`Chr1:52721783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B2,B90
`Chr1:52721788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C72
`Chr1:52721802`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A15,B37,B65,C43,C80
`Chr1:52721802`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A15,B37,B65,C43,C80
`Chr1:52721808`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B107,B29,B3,B7,B72,C29,C34,C47
`Chr1:52721853`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A22,B128,B3,B4,B7,B72,C30,C47
`Chr1:52721864`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B128,B3,B4,B7,B72,C29,C30,C47
`Chr1:52721887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C22,C68
`Chr1:52721887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C68
`Chr1:52721934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C15,C26
`Chr1:52721940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793274.1

977 aa

488

977

LRRNT_2

LRR_1

LRR_14

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 34-70 aa PF00560 LRR_1 99-121 aa PF00560 LRR_1 249-266 aa PF00560 LRR_1 272-292 aa PF00560 LRR_1 321-342 aa PF23598 LRR_14 347-503 aa PF00560 LRR_1 373-395 aa PF00560 LRR_1 397-419 aa PF13855 LRR_8 397-457 aa PF00560 LRR_1 496-517 aa PF00560 LRR_1 518-534 aa PF00560 LRR_1 562-581 aa PF00560 LRR_1 637-659 aa PF00560 LRR_1 710-731 aa PF00560 LRR_1 782-801 aa PF13855 LRR_8 805-863 aa PF00560 LRR_1 807-825 aa PF00560 LRR_1 829-847 aa PF00560 LRR_1 853-869 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	34	70	6e-12	46.3	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	99	121	1.5e-59	185.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	249	266	1.5e-59	185.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	272	292	1.5e-59	185.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	321	342	1.5e-59	185.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	347	503	1.4e-34	120.1	Leucine-rich repeat region
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	373	395	1.5e-59	185.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	397	419	1.5e-59	185.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	397	457	5.7e-49	164.4	Leucine rich repeat
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	496	517	1.5e-59	185.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	518	534	1.5e-59	185.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	562	581	1.5e-59	185.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	637	659	1.5e-59	185.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	710	731	1.5e-59	185.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	782	801	1.5e-59	185.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	805	863	5.7e-49	164.4	Leucine rich repeat
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	807	825	1.5e-59	185.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	829	847	1.5e-59	185.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057793274.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	853	869	1.5e-59	185.7	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937291.1
ATGACTGCCTCTAATCCAACTCTGTTTTCCCTTCTTGTTTTGTTGCTCATGAATATGATTCGTTTCAATTTAAGCCACGCCATTTTCTGCCCACTAATCGAAAAACAGTCACTCCTAAGCTTCAAGGATTCTCTGCAAGATCCTTACCATCAACTCTCTTCATGGCAAGATGATGTCAATTGTTGCAAATGGAATGGTGTCATTTGCAACAGTTTGACTGGCCATGTTCATCAACTCGATTTACATGGTTTGAGTTTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009885
ATGACTGCCTCTAATCCAACTCTGTTTTCCCTTCTTGTTTTGTTGCTCATGAATATGATTCGTTTCAATTTAAGCCACGCCATTTTCTGCCCACTAATCGAAAAACAGTCACTCCTAAGCTTCAAGGATTCTCTGCAAGATCCTTACCATCAACTCTCTTCATGGCAAGATGATGTCAATTGTTGCAAATGGAATGGTGTCATTTGCAACAGTTTGACTGGCCATGTTCATCAACTCGATTTACATGGTTTGAGTTTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793274.1
MTASNPTLFSLLVLLLMNMIRFNLSHAIFCPLIEKQSLLSFKDSLQDPYHQLSSWQDDVNCCKWNGVICNSLTGHVHQLDLHGLSLSGQINPSLLNLKHLTHLDLSLNNFDQAIPLFFGSLTNIEYLNLSFAGFHGKIPHNIGNLSYLYTLDLGGYSNVLYVDSLEWLWGLSELEYLSMSFADLSRAKKWLQVINTLPSLLQLHFRGCSLDYISPHLHYLNITSLTLLDLSFNNFDSMPIPTWIFLLNNLHHLHLSGNSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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