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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003406`

染色体: Chr01 坐标: 52725981-52727578 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003406`
名称	SmilChr01G003406
描述	uncharacterized SmilChr01G003406
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52725981 - 52727578 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993295`
GeneID	`130993295`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993295`
原始查询	`SmilChr01G003406`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993295

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774115.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774115.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774115.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774115.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774115.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52726501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C59
`Chr1:52726536`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B13
`Chr1:52726536`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B13
`Chr1:52726577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:52727029`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	87	A14,A15,A18,A21,A24,A5,B100,B101,B113,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B125,B130,B131,B138,B15,B20,B24,B27,B29,B30,B32,B37,B4,B47,B49,B53,B54,B55,B60,B63,B67,B68,B69,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B87,B9,B90,B92,B97,B98,C11,C12,C15,C17,C18,C2,C22,C27,C36,C41,C42,C43,C44,C45,C50,C51,C54,C55,C57,C60,C64,C65,C66,C68,C69,C7,C74,C78,C80,C83,C86,C9,D1,D10,D3,D9
`Chr1:52727067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B30,B31,C20
`Chr1:52727117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C58
`Chr1:52727171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B132,B53
`Chr1:52727221`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	155	A1,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A23,A24,A4,A7,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B104,B11,B110,B111,B114,B115,B118,B119,B12,B124,B127,B129,B131,B134,B136,B138,B140,B16,B18,B2,B21,B23,B24,B26,B27,B30,B31,B32,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B46,B47,B48,B5,B52,B54,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B63,B65,B66,B70,B71,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B82,B84,B85,B87,B9,B91,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C23,C24,C26,C28,C29,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C57,C58,C6,C60,C63,C64,C66,C67,C68,C7,C70,C71,C74,C76,C8,C82,C83,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr1:52727232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918132.1
AATGCAAAATTTTGTCTCTTTTGTGTGTTTTTTTACCTTTTCTCACGATTTAAGGGGTATATCACAGCGCAGTAAAGGGTTTACTTAGGATTGTCGCCTTTTTATGCTTAATTAGTGTTTATAGTAACTCCTAATTTAATTAGGGTTCATGGTTTATACAAATTAAACTGTGGAGATTGCTGGCCTAAAGTAGAGTAACTCTTCGCCTATTGGTGGCTTATTTATTAAATTGTTGATTGTGGTTAAGTTATTTAACTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993295
ATGCAGATGCTTACACATTTAAGTCTTAAGTGTAGGATTCTATCTATATACGTGGATTGTGGTGTGAATGTTGGAGATGCTAAATCTATAGACAAATCCATCAATCCTATACATGGTTGTCCAGACTTGAGCTATTTGACAACATTGAACTTTGAAAAAGAAGTTTATTCATCTTCAACTGAAGATGAATATGCTAATGTAAAACCAAGGAGAAAGAGGGTAGTTTATGATAAAAAATGTGACCACAAGAGGTTACACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774115.1
MQMLTHLSLKCRILSIYVDCGVNVGDAKSIDKSINPIHGCPDLSYLTTLNFEKEVYSSSTEDEYANVKPRRKRVVYDKKCDHKRLHITLGMRFEDGYQAKEALTTVAIENGWPLHFSRVCKTRMEANCTPPCKWRCYGSAVKRV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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