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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003409`

染色体: Chr01 坐标: 52753425-52755236 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003409`
名称	SmilChr01G003409
描述	uncharacterized SmilChr01G003409
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52753425 - 52755236 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992831`
GeneID	`130992831`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992831`
原始查询	`SmilChr01G003409`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	HSP20-like chaperones superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844011]; symbol=AT1G76770; hit=AT1G76770; species=arabidopsis; confidence=low
产物	HSP20-like chaperones superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844011]; symbol=AT1G76770; hit=AT1G76770; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G76770` (AT1G76770) HSP20-like chaperones superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844011] identity=60.6; qcov=0.352; evalue=1e-44; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00011 (HSP20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992831

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057773579.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057773579.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057773579.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773579.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773579.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52753741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C25
`Chr1:52753761`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C41
`Chr1:52754011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C25
`Chr1:52754217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B102,B18,B32,B87
`Chr1:52754393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:52754586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C7
`Chr1:52754629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:52754955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B41,B6,C28
`Chr1:52754969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773579.1

375 aa

188

375

HSP20

PF00011 HSP20 34-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773579.1`	Pfam	`PF00011`	HSP20	Domain	34	128	8.3e-08	33.0	Hsp20/alpha crystallin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917596.1
ATGAAATAAGATGTTGCACAAAACGTGTCAACTATGTTTGAACATAGCCTCCCGCCAAGGACACGGCGGCATTTTTTTTTTCTTCACAAAACTAAACGAAGCAAAGCATATATTCTTTGCCCTCTTACACCAATTCCTTCCTTGATAAATCAACACTGCCATATTTCCTGACTTTTCCCAATTCATTCATCCAAAAATTTGTCCCAAAATTCATTAAAAAAATATGGAGCTCGAATTAGGACTCAAGTTAACGAGTGTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992831
ATGGAGCTCGAATTAGGACTCAAGTTAACGAGTGTCACCGACGAGTTCACCTCGGATTTTCGGATAGCAAAAGACCGCACCAGCCCCGTCTTCGTGTCTAGAGAAACAGATTCCATGTTCTTCCTCACTGCTCATCTCAAAGGTTATAAGAGAAGGAATATAAAGATCGACATAAACGAGGACGGGAGCTTGATCGGAATAGGCGGCGAAAAGCAGGTGCAAGAAACGGTAATGGTGGGGTGGAAAGTTTACAAGAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773579.1
MELELGLKLTSVTDEFTSDFRIAKDRTSPVFVSRETDSMFFLTAHLKGYKRRNIKIDINEDGSLIGIGGEKQVQETVMVGWKVYKKEREIKGFKKVFRIPQGVILDKIKAKFNDDESTLSITMPKKVKGIRVGTAIEEVEDKPDLVRAGSGSLQIADEKSPKAETSNLEMDEKSKARIGEDEAVDQAPSNGGEAKPEEEKHQEKPEEEKHQEKPVSAHDFKDGKVDHVEADTCREDEEKQRNTDDVRGITEPKEHEGKDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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