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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003416`

染色体: Chr01 坐标: 52797685-52800784 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003416`
名称	SmilChr01G003416
描述	protein SET DOMAIN GROUP 41-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52797685 - 52800784 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992252`
GeneID	`130992252`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992252`
原始查询	`SmilChr01G003416`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SET DOMAIN GROUP 41-like
产物	protein SET DOMAIN GROUP 41-like
Arabidopsis	`AT1G43245` (AT1G43245) SET domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840925] identity=30.6; qcov=1.02; evalue=4.74e-82; confidence=low
Rice	`Os04g0423600` (OsSET18) - identity=31.6; qcov=1.05; evalue=5.04e-72; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00856 (SET)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992252

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772791.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772791.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772791.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772791.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772791.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52798022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:52798172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:52798353`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B73
`Chr1:52798353`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B73
`Chr1:52798438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:52798686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	113	A10,A14,A2,A25,A3,B101,B102,B103,B106,B112,B114,B115,B117,B119,B120,B13,B131,B137,B138,B14,B140,B16,B18,B2,B20,B21,B23,B29,B3,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B41,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B50,B58,B6,B61,B63,B65,B67,B70,B73,B75,B76,B78,B79,B8,B81,B83,B84,B85,B86,B89,B90,B94,C1,C10,C12,C13,C14,C18,C19,C20,C21,C22,C24,C27,C28,C29,C30,C31,C34,C35,C38,C39,C4,C42,C44,C45,C46,C48,C49,C5,C50,C52,C55,C56,C59,C6,C63,C65,C68,C7,C73,C75,C76,C83,C86,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr1:52800615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:52800676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B89,B92
`Chr1:52800676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772791.1

622 aa

311

622

SET

PF00856 SET 214-303 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772791.1`	Pfam	`PF00856`	SET	Family	214	303	1e-05	26.6	SET domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916808.1
TAGGCCCATTTACATCATCGAAATTTTCTTTACAAGTCTAATAAAAATGGAGATGAGAGCAATCGAAGATATCGGCATAGGCCAAGACCTCACTCCGCCCCTCCGCCCCCTCGCCGCCGTCCTACACGACGCCGCCTTCGGCACCCGCTGCTCCGCCTGCTTCACCGTCCTCCCTCCGCAGCCATTTCCTCCTTCTGCCCTCAACTTTCCCGGTTATGTCCCAACCGACACTCGCGCCACTCCTCTCTACTGTTCCCTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992252
ATGGAGATGAGAGCAATCGAAGATATCGGCATAGGCCAAGACCTCACTCCGCCCCTCCGCCCCCTCGCCGCCGTCCTACACGACGCCGCCTTCGGCACCCGCTGCTCCGCCTGCTTCACCGTCCTCCCTCCGCAGCCATTTCCTCCTTCTGCCCTCAACTTTCCCGGTTATGTCCCAACCGACACTCGCGCCACTCCTCTCTACTGTTCCCTCGCCTGCTCCGCTGCCGATTCCCCCTTGCATTTCTCCTCCTTCGAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772791.1
MEMRAIEDIGIGQDLTPPLRPLAAVLHDAAFGTRCSACFTVLPPQPFPPSALNFPGYVPTDTRATPLYCSLACSAADSPLHFSSFEHRLIAHFATSPPSTWQSSTELRLSLRLAHVFQNLPRYMSFLGENEKPGGCLERMAGLMTNREKFVFDEIKKALIARDNKSSGKVKRITEGARMMAWARGKDVSSGRFAFEEAVLCLVMTNAVEVQEMTGFCIGIAVYDATFSWINHSCSPNCCYWFLMGPGEDEQPPLRIAPAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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