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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003432`

染色体: Chr01 坐标: 52952881-52953432 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003432`
名称	SmilChr01G003432
描述	vinorine synthase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52952881 - 52953432 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009902`
GeneID	`131009902`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009902`
原始查询	`SmilChr01G003432`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vinorine synthase-like
产物	vinorine synthase-like
Arabidopsis	`AT1G24430` (AT1G24430) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839059] identity=32.3; qcov=0.847; evalue=2.46e-17; confidence=low
Rice	`Os09g0422000` (HCT3) - identity=33.1; qcov=0.678; evalue=1.26e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009902

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057793289.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057793289.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057793289.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057793289.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793289.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52952910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C49,C62
`Chr1:52952973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B64,C18,C36,C49,C62
`Chr1:52952984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B64,C18,C36,C49,C62
`Chr1:52952992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B64,C18,C36,C49,C62
`Chr1:52952998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B69,B82
`Chr1:52953001`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B133,B137,B2,C26
`Chr1:52953001`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B133,B137,B2,C26
`Chr1:52953027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr1:52953046`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B72,B73
`Chr1:52953046`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B72,B73
`Chr1:52953070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B33,B77
`Chr1:52953101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793289.1

183 aa

183

Transferase

PF02458 Transferase 27-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793289.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	27	168	4.3e-21	75.8	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937306.1
ATGCTGGACCAGATTTTCCTGCCAATAGCTCTTCCTTTCGCCCTCTATTACCCGAACACGACGCAAATCAACGATCCAGATTCGTTCATTTCTCAAACATTGCAGCAACTGACCCGATCGCTATCCGTGATTTTGACCCGGTTCTATCCGCTGGCAGAGAGAGCTAGCAAAGAGGGCGAATTCATCGACTGCAATGACGACGGTGTTCCCTTCACCGTCGCCCGATTCAAAGGCCATGAGCTTTCAGAGCATTTGGCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009902
ATGCTGGACCAGATTTTCCTGCCAATAGCTCTTCCTTTCGCCCTCTATTACCCGAACACGACGCAAATCAACGATCCAGATTCGTTCATTTCTCAAACATTGCAGCAACTGACCCGATCGCTATCCGTGATTTTGACCCGGTTCTATCCGCTGGCAGAGAGAGCTAGCAAAGAGGGCGAATTCATCGACTGCAATGACGACGGTGTTCCCTTCACCGTCGCCCGATTCAAAGGCCATGAGCTTTCAGAGCATTTGGCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793289.1
MLDQIFLPIALPFALYYPNTTQINDPDSFISQTLQQLTRSLSVILTRFYPLAERASKEGEFIDCNDDGVPFTVARFKGHELSEHLADPRPDLLLSCDTDWGTDPDPNSVVALIQVNCSDVAIGVAFWHKVVDASTVSAILRSWGAVARGGKEPVDRSISHNDCNIYNDNPRIFRPKSLTCSHS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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