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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003464`

染色体: Chr01 坐标: 53217848-53222611 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003464`
名称	SmilChr01G003464
描述	monooxygenase 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	53217848 - 53222611 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992751`
GeneID	`130992751`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992751`
原始查询	`SmilChr01G003464`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	monooxygenase 2-like
产物	monooxygenase 2-like
Arabidopsis	`AT5G05320` (AT5G05320) FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830414] identity=47.3; qcov=0.988; evalue=7.08e-133; confidence=high
Rice	`Os03g0154100` - identity=50.9; qcov=0.98; evalue=4.62e-141; confidence=high
GO	GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF00890 (FAD_binding_2); PF01266 (DAO); PF01494 (FAD_binding_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992751

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057773483.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057773483.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773483.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773483.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773483.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:53220772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B132
`Chr1:53221252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,C21,C77,C83
`Chr1:53222025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B23,B51,D2
`Chr1:53222068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:53222122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,D3
`Chr1:53222130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr1:53222264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B51,D2
`Chr1:53222288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr1:53222299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773483.1

409 aa

204

409

FAD_binding_3

FAD_binding_2

DAO

PF01494 FAD_binding_3 8-355 aa PF00890 FAD_binding_2 9-46 aa PF01266 DAO 9-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773483.1`	Pfam	`PF01494`	FAD_binding_3	Domain	8	355	1.6e-22	81.0	FAD binding domain
`XP_057773483.1`	Pfam	`PF00890`	FAD_binding_2	Domain	9	46	7.6e-05	22.8	FAD binding domain
`XP_057773483.1`	Pfam	`PF01266`	DAO	Domain	9	120	5.3e-08	33.5	FAD dependent oxidoreductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917500.1
TTTCGATGTTACGTTCAAGCACGAAGAATAGGATCATTCCTTCATTATCCAAGCTCAAAGATTTCCTCGAATCTGGTCATGAAGTGGCCAGACTTTTGAAAAGATCTGCCTGGTTTTTGACAACAGATTTGGATGAATCCTTAATGCTGAATGTGGAAATCCTCAAGAGCTGCGGTATACCTATGGAGCGTATCCAGCACTTCCTCTATATTCGGCCGAGATGCTTCTTGGTGAAGCCTCATATTATGAGGAAATCTGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992751
ATGGAACCCGCGATCCACGAGCAAGATATTTTGATAGTCGGAGGCGGCATAGCTGGCCTCACCACAGCTCTCGGACTCCACAGGTTGGGGATTCGGAGCCTGGTTTTGGAGGCGTCGGATGGATTGAGAACCACAGGGTTCGCCCTAACTTTATGGACGAACGCGTGGATAGCTCTAGATGCAGTCGGAATCGGCGACGCCATGAGAGCCAATTCTCTCCCAATTCAAGGTTTCAAAGTCGGTAGCTTGGATTCCACCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773483.1
MEPAIHEQDILIVGGGIAGLTTALGLHRLGIRSLVLEASDGLRTTGFALTLWTNAWIALDAVGIGDAMRANSLPIQGFKVGSLDSTSSSPKQGVETDFKLGKFEKRCVRRIDLLELLERELPQGSVRYSSKIVCIEESGNFKLVHLSDGSIFRTKVLLGCDGVNSMVAQWLGLKSPVSAARAAIRGYVVYPDGHNLEPKMYAYFGGGVRIGFVPCDDNDIYWFCTFTPSLFKYDESERDPSKMKQFVISKIGSARKHVLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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