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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003470`

染色体: Chr01 坐标: 53248145-53250479 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003470`
名称	SmilChr01G003470
描述	expansin-A11-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	53248145 - 53250479 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993114`
GeneID	`130993114`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993114`
原始查询	`SmilChr01G003470`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	expansin-A11-like
产物	expansin-A11-like
Arabidopsis	`AT1G20190` (EXPA11) expansin 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838608] identity=76; qcov=0.812; evalue=2.34e-136; confidence=high
Rice	`Os04g0228400` (OsEXP1) - identity=73.4; qcov=0.864; evalue=6.63e-140; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0009664 (plant-type cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C); PF03330 (DPBB_1); PF22514 (EXPB1_D1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993114

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057773852.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057773852.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057773852.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773852.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773852.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:53248351`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C40
`Chr1:53248351`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C40
`Chr1:53248488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B46,B67
`Chr1:53248535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:53248716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C17
`Chr1:53248971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr1:53249971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr1:53250007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,D4
`Chr1:53250091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773852.1

287 aa

144

287

EXPB1_D1

DPBB_1

Expansin_C

PF22514 EXPB1_D1 66-191 aa PF03330 DPBB_1 96-184 aa PF01357 Expansin_C 195-272 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773852.1`	Pfam	`PF22514`	EXPB1_D1	Domain	66	191	8.1e-08	33.4	EXPB1-like domain 1
`XP_057773852.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	96	184	3.7e-24	85.5	Lytic transglycolase
`XP_057773852.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	195	272	7.2e-28	97.3	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917869.1
ATTTATTTCATCCATTCACGGCTATCTTCCCCTCCATGTGGATGAGAACGTGGGAATAATTGAATGAGATTCAGATTTCTCGGAGATAATCTTTTTTATTTTCTTTTCTTTTCTTTTTCCACCGATTTTCTTCCTCAGTTTTCTCTTTTTTCCTCTGCTAATTGCAGGCCCATCACATGCGACCTCTGCTTCCCCTCCCCACCTATATAAACCCCACTAATAAATCTTCAATATTTATCATTCCCAAATTAAATTCACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993114
ATGCGACCTCTGCTTCCCCTCCCCACCTATATAAACCCCACTAATAAATCTTCAATATTTATCATTCCCAAATTAAATTCACTTCCAAGAAAAATGCATTCAAAAAGAAGCAGAGTTTTTGATTTAGTGTTGGTGTTGTGCTGCTTCATCAACAATGCTGCTGCTTTCACCGCCTCCGGATGGACGCAGGCCCACGCCACCTTCTATGGAGGCTCCGACGCCTCCGGCACCATGGGGGGTGCGTGTGGGTATGGAAACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773852.1
MRPLLPLPTYINPTNKSSIFIIPKLNSLPRKMHSKRSRVFDLVLVLCCFINNAAAFTASGWTQAHATFYGGSDASGTMGGACGYGNLYSAGYGTRTAALSTALFNNGASCGQCFKIMCDYNADPKWCKKGVSVTVTATNFCPPNFDLPSDNGGWCNPPRQHFDMAQPAWEKIGIYRGGIVPVIYQRVPCKKHGGVRFTINGRDYFELVMISNVANGGSVQSVEIKGSKTGWMSMSRNWGANWQSNSYLDGQSISFKVTTS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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