当前解析结果
SmilChr01G003502| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003502 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003502 |
| 描述 | NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 53613710 - 53616050 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993417 |
|---|---|
| GeneID | 130993417 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993417 |
| 原始查询 | SmilChr01G003502 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2-like |
| 产物 | NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 2-like |
| Arabidopsis | AT1G76200 (AT1G76200)NADH dehydrogenase ubiquinone 1 beta subcomplex subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843953] identity=91.7; qcov=0.738; evalue=6.45e-28; confidence=medium |
| Rice | Os05g0122900 (OsBLE1)- identity=76.6; qcov=0.723; evalue=2.77e-21; confidence=medium |
| GO | GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0005747 (GO:0005747) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993417 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057774280.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057774280.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 1.00000 | XP_057774280.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057774280.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774280.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:53614705 |
CCT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B124 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。