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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003507`

染色体: Chr01 坐标: 53647615-53653795 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003507`
名称	SmilChr01G003507
描述	L-ascorbate oxidase homolog
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	53647615 - 53653795 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992366`
GeneID	`130992366`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992366`
原始查询	`SmilChr01G003507`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-ascorbate oxidase homolog
产物	L-ascorbate oxidase homolog
Arabidopsis	`AT1G76160` (sks5) SKU5 similar 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843948] identity=79.8; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0678800` - identity=70; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992366

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057772951.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772951.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772951.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772951.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772951.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:53648228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B75
`Chr1:53648279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B50,D4
`Chr1:53650042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B24,C58
`Chr1:53650258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C16
`Chr1:53650276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:53650291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B24,C58
`Chr1:53650295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B115,C32
`Chr1:53651910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C59
`Chr1:53651911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B18,B57,C7,D4
`Chr1:53651976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B113
`Chr1:53651988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A5,C61,C78
`Chr1:53652159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772951.1

538 aa

269

538

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 27-141 aa PF00394 Cu-oxidase 154-292 aa PF07731 Cu-oxidase_2 373-510 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772951.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	27	141	2e-37	128.6	Multicopper oxidase
`XP_057772951.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	154	292	1.2e-44	152.9	Multicopper oxidase
`XP_057772951.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	373	510	3.5e-33	115.0	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916968.1
TGAATTCTCAATCTCAAACACTTAACTCTATACTATTACCTTGATCAATGAAAACGCGTTTTTATTTTTATTATGATTCATCTCTAGTAATGAAATTACTGATCGTGTAGATGAAAATTCAAATTTCCAGCCAATTAAAAGCAAGTTGCCAAAGTAATTCCAAATCTTTCCTTTATTTATTATTTTTATTTTCGTCACAGCCATATACGAGTCTCTTTCTCGGCAGTCTCACTCTGCACTCTGCATCGCATTTGTTATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992366
ATGCCGCTAAGATTAGCGGTTGTTTTGGCGTTTCTCGCCATTGCTGCAGCAGAGGATCCTTACCGATTCTTCACTTGGAATGTCACCTATGGCACCATTTGGCCACTCGGCGTTCCCCAGCAGGGCATTCTGATAAATGGCCAATTTCCTGGACCTGAAATCTATTCCGTCACCAACGATAACATTATCGTCAACGTCTTCAACAGCTTGGATGAGCCCTTCCTCATTCACTGGAATGGGATTCAAAATAGGAGGAATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772951.1
MPLRLAVVLAFLAIAAAEDPYRFFTWNVTYGTIWPLGVPQQGILINGQFPGPEIYSVTNDNIIVNVFNSLDEPFLIHWNGIQNRRNSYEDGVLGTTCPIPPGKNFTYILQMKDQIGSFSYFPSLGFHKAAGGFGGIRILSRPGIPVPFDNPADDFTALIGDWYAANHTALRGILDGGNKLPFPDGILINGRGPNATATSFNVEQGKTYRFRICNVGLQNSLNFRIQGHKMKVVEVEGTHTLQISYSSLDVHVGQCMSVLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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