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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003508`

染色体: Chr01 坐标: 53666428-53671839 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003508`
名称	SmilChr01G003508
描述	uncharacterized SmilChr01G003508
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	53666428 - 53671839 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993573`
GeneID	`130993573`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993573`
原始查询	`SmilChr01G003508`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Pseudouridine synthase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838630]; symbol=AT1G20410; hit=AT1G20410; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Pseudouridine synthase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838630]; symbol=AT1G20410; hit=AT1G20410; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G20410` (AT1G20410) Pseudouridine synthase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838630] identity=51.5; qcov=0.948; evalue=1.34e-177; confidence=high
Rice	`Os04g0561700` - identity=49.5; qcov=0.986; evalue=7.5e-176; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0009982 (pseudouridine synthase activity); GO:0031119 (tRNA pseudouridine synthesis)
KEGG	-
Pfam	PF21237 (Pus10_N_euk); PF21238 (Pus10_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993573

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774487.1`
2	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057774487.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774487.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774487.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774487.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:53666525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B2,B35,C26,C35
`Chr1:53666534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:53666566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B75,D11
`Chr1:53666586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:53666608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:53667338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:53669148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr1:53669324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C16
`Chr1:53669331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:53669479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr1:53670801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774487.1

553 aa

276

553

Pus10_N_euk

Pus10_C

PF21237 Pus10_N_euk 113-254 aa PF21238 Pus10_C 314-546 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774487.1`	Pfam	`PF21237`	Pus10_N_euk	Domain	113	254	7e-11	42.9	Eukaryotic Pus10, N-terminal
`XP_057774487.1`	Pfam	`PF21238`	Pus10_C	Domain	314	546	9.9e-84	281.2	Pus10, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918504.1
CGGTATTAATATTTCGTTTCCAATATACAAACAGGGAATAACCACCGCCGTCTCCCTAGCTTTCCGCTCCACTTTCAAATGGCCAGCGACGGCGCTCCACTTATCAGTGATACCACACACGCGCACGTTATCTCCGCCGCCGAAGCCGACAACAATGACCTGAAGCTCCTCCGCCTCGCCGTCCGCTCGCTGCCGCCACAAATTCTCAAGGACTTGCTGTCCAATGGCGTTTGCGCACGCTGTATAATTAATCAATTTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993573
ATGGCCAGCGACGGCGCTCCACTTATCAGTGATACCACACACGCGCACGTTATCTCCGCCGCCGAAGCCGACAACAATGACCTGAAGCTCCTCCGCCTCGCCGTCCGCTCGCTGCCGCCACAAATTCTCAAGGACTTGCTGTCCAATGGCGTTTGCGCACGCTGTATAATTAATCAATTTGGTCTGCACGAGCAAATATGTTCTCGTCCTTCAGTTGCAACGCCTGTTTTGAGTGCGATTCTTCATGAATCGGCAGAGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774487.1
MASDGAPLISDTTHAHVISAAEADNNDLKLLRLAVRSLPPQILKDLLSNGVCARCIINQFGLHEQICSRPSVATPVLSAILHESAERGDDGANSSVGENKDAIDVENGFQEVCRVCLGILQFLYIDDNGISVRKSHACDFAAAVADPVKQGGYQIDSFSLQVSLPPIVVDNEQAVWSYIKEKYSSESWFTEKFPLASITVKDFLKLSVANPLEKLLDVKCNDNSFRVRLTYTLSDASAENKPFNESNGCYKRRKIDDTDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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