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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003525`

染色体: Chr01 坐标: 53878007-53885531 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003525`
名称	SmilChr01G003525
描述	monooxygenase 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	53878007 - 53885531 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994061`
GeneID	`130994061`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994061`
原始查询	`SmilChr01G003525`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	monooxygenase 2-like
产物	monooxygenase 2-like
Arabidopsis	`AT4G38540` (AT4G38540) FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830011] identity=48.1; qcov=0.99; evalue=7.98e-131; confidence=high
Rice	`Os03g0154100` - identity=50.1; qcov=0.98; evalue=2.26e-139; confidence=high
GO	GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF00890 (FAD_binding_2); PF01266 (DAO); PF01494 (FAD_binding_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994061

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057775082.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775082.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057775082.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775082.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775082.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:53882961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr1:53884971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr1:53885031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B92
`Chr1:53885088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,C17,C29,C40,C74
`Chr1:53885169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B23,B51,D2
`Chr1:53885250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr1:53885292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B28,B33
`Chr1:53885335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775082.1

409 aa

204

409

FAD_binding_3

DAO

FAD_binding_2

PF01494 FAD_binding_3 8-355 aa PF01266 DAO 9-56 aa PF00890 FAD_binding_2 9-57 aa

XP_057775085.1

409 aa

204

409

FAD_binding_3

DAO

FAD_binding_2

PF01494 FAD_binding_3 8-355 aa PF01266 DAO 9-56 aa PF00890 FAD_binding_2 9-57 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775082.1`	Pfam	`PF01494`	FAD_binding_3	Domain	8	355	1.2e-21	78.1	FAD binding domain
`XP_057775082.1`	Pfam	`PF01266`	DAO	Domain	9	56	2.4e-07	31.4	FAD dependent oxidoreductase
`XP_057775082.1`	Pfam	`PF00890`	FAD_binding_2	Domain	9	57	5.2e-05	23.3	FAD binding domain
`XP_057775085.1`	Pfam	`PF01494`	FAD_binding_3	Domain	8	355	1.2e-21	78.1	FAD binding domain
`XP_057775085.1`	Pfam	`PF01266`	DAO	Domain	9	56	2.4e-07	31.4	FAD dependent oxidoreductase
`XP_057775085.1`	Pfam	`PF00890`	FAD_binding_2	Domain	9	57	5.2e-05	23.3	FAD binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009091765.1
TGATTTATTTTCGGCAACTTTAAGCAAAAATGATCTGTTGGACTATTGAAACTAAAGCTTCTTCCCTCCCTGCCATGGCGACGGCGCTGGTTCAAAAACCCTCAATCGACAAGCTTTGAGTCTTTGATTTTGCAGGCAAGTCCCTTTCATTTCCGAACACACATTCTATTTATATCAATCAACATGATTGCAATTGCACGCAAGAACCTCTCCTGTTTACGTTTGAACCCTAATTCATTTCTCAGCAACTCAAATCTTCA...

XR_009091764.1
TGATTTATTTTCGGCAACTTTAAGCAAAAATGATCTGTTGGACTATTGAAACTAAAGCTTCTTCCCTCCCTGCCATGGCGACGGCGCTGGTTCAAAAACCCTCAATCGACAAGCTTTGAGTCTTTGATTTTGCAGGCAAGTCCCTTTCATTTCCGAACACACATTCTATTTATATCAATCAACATGATTGCAATTGCACGCAAGAACCTCTCCTGTTTACGTTTGAACCCTAATTCATTTCTCAGCAACTCAAATCTTCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130994061
ATGGAAGCCACGATCCACGAGCAAGATATTTTGATAGTCGGAGGCGGCATAGCTGGCCTCACCACAGCTCTCGGACTTCACAGATTGGGGATTCGGAGCTTGGTTTTGGAAGCGTCGGATGGATTGAGAACCACGGGGTTCGCCCTAACCATGTGGACGAACGCGTGGATAGCTCTAGATGCAGTCGGAATCGGCGACGCCATGAGAGCCGATTCTCTCCCGATTCAAGGTTTCGAAGTCGGTAGCTTGGATTCCACCTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057775082.1
MEATIHEQDILIVGGGIAGLTTALGLHRLGIRSLVLEASDGLRTTGFALTMWTNAWIALDAVGIGDAMRADSLPIQGFEVGSLDSTSSSPEQGVETDFKLGKFESRCVRRTDLLELLERELPQGSVRYSSKIVCIEESGNFKLVHLSDGSIFRTKALLGCDGVNSMVAQWLGLKSPVSAARAAIRGYVVYPDGHGFEPKLYAYFGGGVRIGFVPCDGKGIYWFCTFTPSLFKYDESERDPSKMKQFVISKIGSARKHVMD...

XP_057775085.1
MEATIHEQDILIVGGGIAGLTTALGLHRLGIRSLVLEASDGLRTTGFALTMWTNAWIALDAVGIGDAMRADSLPIQGFEVGSLDSTSSSPEQGVETDFKLGKFESRCVRRTDLLELLERELPQGSVRYSSKIVCIEESGNFKLVHLSDGSIFRTKALLGCDGVNSMVAQWLGLKSPVSAARAAIRGYVVYPDGHGFEPKLYAYFGGGVRIGFVPCDGKGIYWFCTFTPSLFKYDESERDPSKMKQFVISKIGSARKHVMD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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