当前解析结果
SmilChr01G003530| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003530 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003530 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003530 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 53928653 - 53930473 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994520 |
|---|---|
| GeneID | 130994520 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994520 |
| 原始查询 | SmilChr01G003530 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os05g0114600; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os05g0114600; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT4G22000 (AT4G22000)tyrosine sulfotransferase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828289] identity=71.5; qcov=0.847; evalue=1.99e-56; confidence=high |
| Rice | Os05g0114600- identity=69.8; qcov=0.92; evalue=9.29e-57; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994520 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057775549.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057775549.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775549.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775549.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057775549.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:53929861 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B105,B75,B82 |
Chr1:53929941 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B124,B23,D2 |
Chr1:53930007 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A5,A9,B19 |
Chr1:53930008 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。