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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003531`

染色体: Chr01 坐标: 53931251-53933708 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003531`
名称	SmilChr01G003531
描述	SKP1-like protein 1A
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	53931251 - 53933708 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994372`
GeneID	`130994372`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994372`
原始查询	`SmilChr01G003531`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SKP1-like protein 1A
产物	SKP1-like protein 1A
Arabidopsis	`AT1G75950` (SKP1) S phase kinase-associated protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843928] identity=79.5; qcov=0.958; evalue=5.12e-85; confidence=high
Rice	`Os09g0539500` (OSK20) - identity=71; qcov=1.05; evalue=1.91e-75; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0097602 (cullin family protein binding)
KEGG	smil03083 (Polycomb repressive complex - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01466 (Skp1); PF03931 (Skp1_POZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994372

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057775401.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775401.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775401.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775401.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775401.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:53931523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,C19,C60,C71
`Chr1:53933194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775401.1

168 aa

168

Skp1_POZ

Skp1

PF03931 Skp1_POZ 10-69 aa PF01466 Skp1 119-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775401.1`	Pfam	`PF03931`	Skp1_POZ	Domain	10	69	1.9e-28	99.1	Skp1 family, tetramerisation domain
`XP_057775401.1`	Pfam	`PF01466`	Skp1	Domain	119	166	7.7e-32	109.6	Skp1 family, dimerisation domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919418.1
ATCTGGAAAGGAAAAGGATTCACTTCCGTAAAATCCCATATAAAATAAAGTTATGTGTCTAATCAGGGATTCATGGATATTTTCTGATAAATTACCATCAAAGATAATTAAAATTAAATAAAGCTAAAGAAAATTATCATCAAAATCAAAATCCCATTTTCTTAAGAAAAATATTTTTTAAATCCTTTTTTTTCTCTTCCTTGGAAGCGATATATTCAGCTCCCCTATTTATATTTCTGTAGCCAAAATCCCTAAATAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994372
ATGGCGTCCGCGTCGGAGAACTCCGGCAAGAAGATTGTCCTCCGAAGCTCCGACGCTGAGGTGTTCGAGGTGGACGAGGCGGTCGCCGTCGAGTCCCAGACGATCAAGCACATGATCGAGGACGACTGCGTCGACAACATCATTCCAATCCCCAACGTCACCGGCAAAATCCTCTCCAAGGTCATCGAGTACTGCAAAAAACACGTCGATGCCGCCGCCACCTCCGCTTCAAACAAGGCCGAGGACAAGGTCGCCTCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775401.1
MASASENSGKKIVLRSSDAEVFEVDEAVAVESQTIKHMIEDDCVDNIIPIPNVTGKILSKVIEYCKKHVDAAATSASNKAEDKVASSDDELKSFDADFVKVDQATLFDLILAANYLNIKSLLDLTCQTVADMIKGKTPEEIRKTFNIKNDFTPEEEEEVRRENQWAFE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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