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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003532`

染色体: Chr01 坐标: 53935019-53946965 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003532`
名称	SmilChr01G003532
描述	tRNA ligase 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	53935019 - 53946965 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993674`
GeneID	`130993674`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993674`
原始查询	`SmilChr01G003532`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA ligase 1-like
产物	tRNA ligase 1-like
Arabidopsis	`AT1G07910` (RNL) RNAligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837306] identity=66; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0191700` - identity=64.1; qcov=0.942; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003972 (RNA ligase (ATP) activity); GO:0006388 (tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993674

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057774652.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057774652.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057774662.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774652.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774652.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:53935230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B56,B64,B96
`Chr1:53935244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:53935261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:53935551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B125
`Chr1:53935844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B35,C35,C37
`Chr1:53936019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B32,D10
`Chr1:53936680`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C47
`Chr1:53936680`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C47
`Chr1:53936684`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C47
`Chr1:53936684`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C47
`Chr1:53936835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C11
`Chr1:53936840`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	141	A1,A14,A16,A18,A19,A20,A23,A24,A25,A3,A7,A8,B1,B102,B104,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B113,B114,B119,B12,B120,B123,B124,B125,B126,B127,B129,B130,B133,B134,B135,B137,B139,B14,B140,B16,B17,B18,B22,B23,B25,B26,B28,B29,B30,B32,B33,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B46,B5,B50,B51,B52,B53,B57,B59,B6,B61,B62,B63,B66,B67,B69,B7,B70,B72,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B89,B9,B91,B99,C12,C13,C14,C15,C2,C20,C23,C28,C3,C30,C33,C34,C36,C39,C41,C42,C45,C47,C5,C51,C52,C57,C59,C6,C62,C63,C64,C66,C67,C7,C70,C73,C74,C76,C79,C8,C82,C9,D1,D10,D11,D2,D5,D6,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918669.1
ATTGAGATATTTTCTTTTGTACTTTCGAGTTAGATTTTGATAAGCAAAATATAACTAGCTAGGTGATTATTCCCACTCTCTCTCACCCATCACCATGCCTCATTTTCTCTCACTCATCACCATGCCTCGCAAGCGGAAGCAGCGACGAGGAGTCAGTGAAGAACACAGACGGGTGAAGAAGTCGAAAGTCCACAAGTTGCCTGCCTCGTTGCCTTCAGCTTCAGTAAGTGGCTTCACTGCAGTAGTGGGACTAAATTCAG...

XM_057918679.1
ACGTCCTATTGAGATATTTTCTTTTGTACTTTCGAGTTAGATTTTGATAAGCAAAATATAACTAGCTAGGTGATTATTCCCACTCTCTCTCACCCATCACCATGCCTCATTTTCTCTCACTCATCACCATGCCTCGCAAGCGGAAGCAGCGACGAGGAGTCAGTGAAGAACACAGACGGGTGAAGAAGTCGAAAGTCCACAAGTTGCCTGCCTCGTTGCCTTCAGCTTCAGTAAGTGGCTTCACTGCAGTAGTGGGACTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993674
ATGCCTCATTTTCTCTCACTCATCACCATGCCTCGCAAGCGGAAGCAGCGACGAGGAGTCAGTGAAGAACACAGACGGGTGAAGAAGTCGAAAGTCCACAAGTTGCCTGCCTCGTTGCCTTCAGCTTCAGTAAGTGGCTTCACTGCAGTAGTGGGACTAAATTCAGTTGATCAAACGACCAAACTAGGCAATGGAGTCCAAACGGAATCTGCTGCTGTTTTGAGCAAGGTTCTTAGCGATGAATCATTGGAAAGCTTCAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774652.1
MPHFLSLITMPRKRKQRRGVSEEHRRVKKSKVHKLPASLPSASVSGFTAVVGLNSVDQTTKLGNGVQTESAAVLSKVLSDESLESFTTDSSTSSLAQVRAAFYPKFENEKSDQEVRKRMIEMVSKGLATVEVSLKHSGSLFMYAGHEGGAYAKNSYGNIYTAVGVFVLGRMFCEAWGSQASEKQSEFNQFLERNRMCVSMELVTAVLGDHGQRPREDYVVVTAVTELGNGKPKFYSTPDLISFCRKWRLPSNHVWLFSTR...

XP_057774662.1
MPHFLSLITMPRKRKQRRGVSEEHRRVKKSKVHKLPASLPSASVSGFTAVVGLNSVDQTTKLGNGVQTESAAVLSKVLSDESLESFTTDSSTSSLAQVRAAFYPKFENEKSDQEVRKRMIEMVSKGLATVEVSLKHSGSLFMYAGHEGGAYAKNSYGNIYTAVGVFVLGRMFCEAWGSQASEKQSEFNQFLERNRMCVSMELVTAVLGDHGQRPREDYVVVTAVTELGNGKPKFYSTPDLISFCRKWRLPSNHVWLFSTR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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