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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003536`

染色体: Chr01 坐标: 53984113-53988903 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003536`
名称	SmilChr01G003536
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	53984113 - 53988903 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993925`
GeneID	`130993925`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993925`
原始查询	`SmilChr01G003536`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27
产物	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27
Arabidopsis	`AT4G39370` (UBP27) ubiquitin-specific protease 27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830092] identity=40.3; qcov=1.04; evalue=3.79e-114; confidence=medium
Rice	`Os04g0647300` - identity=24.7; qcov=0.892; evalue=8.44e-09; confidence=weak
GO	GO:0004197 (cysteine-type endopeptidase activity); GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0016579 (protein deubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00443 (UCH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993925

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057774947.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057774953.1`
3	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.20000	`XP_057774947.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057774953.1`
5	Peroxisome membrane	过氧化物酶体膜	0.20000	`XP_057774947.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:53984405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:53985648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B55,C19
`Chr1:53985673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr1:53985702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:53986363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:53986397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C8
`Chr1:53986528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,C19
`Chr1:53987013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B55,C19
`Chr1:53987361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A20,A23,A8,B128,B13,B132,B140,B15,B29,B35,B56,B64,B71,B76,B86,B96,C30,C31,C44,C53,C55,C56,D10
`Chr1:53988279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr1:53988323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:53988339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774947.1

538 aa

269

538

UCH

PF00443 UCH 73-532 aa

XP_057774953.1

517 aa

258

517

UCH

PF00443 UCH 73-511 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774947.1`	Pfam	`PF00443`	UCH	Family	73	532	3.3e-47	162.0	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase
`XP_057774953.1`	Pfam	`PF00443`	UCH	Family	73	511	1.2e-36	127.3	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918964.1
TTATCGAAGCCTTTCAAAAATTATAACCAATTCACAAAATAGAAGAAAATGGCGATTTATCTTACTACTAGTTTGAAATAAAAAAAGGTTTAATGATTTTGGAAAATGAAGAGCCTGATATATGATTTAAATAGAAAAGATTATTATAAGGAGAAAAAGCAGCAGAAGCTATCAAAGACCGGCGAGGAATTCGAGAGGTTTCTTTAAAACCTCTCCGTTTAATCGGCGGCGGCGATTATGCGGCGGCCAAATCGCGTCCG...

XM_057918970.1
AAAAGATTATTATAAGGAGAAAAAGCAGCAGAAGCTATCAAAGACCGGCGAGGAATTCGAGAGGTTTCTTTAAAACCTCTCCGTTTAATCGGCGGCGGCGATTATGCGGCGGCCAAATCGCGTCCGAATGGGGACAAAGAAACTGAGTTCTTTGATTCGCAATGGTCGTAGAATAAACTGGGTCTCGAGTTCTGGTTGGAAAATCTCAATTGGTGTGCTAGGTGCTGTTGGTATAATCTTCGCATCAAGATTTAGAAAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993925
ATGCGGCGGCCAAATCGCGTCCGAATGGGGACAAAGAAACTGAGTTCTTTGATTCGCAATGGTCGTAGAATAAACTGGGTCTCGAGTTCTGGTTGGAAAATCTCAATTGGTGTGCTAGGTGCTGTTGGTATAATCTTCGCATCAAGATTTAGAAAATATCTCGACTTCAACATCTCATATCAAGACGCAGCTTCTACTGGTGTTTGGGTTGTCCCCGGATTGAGAAATCTCGGGAATAATTGTTTCTTGAATGTTGTTTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774947.1
MRRPNRVRMGTKKLSSLIRNGRRINWVSSSGWKISIGVLGAVGIIFASRFRKYLDFNISYQDAASTGVWVVPGLRNLGNNCFLNVVLQTLSSCASFRKYLWEMMEEYGSLSAEEVDDKCGDENLPLFSSLASLVEELCSVRHQRTVLNPRKLMAAMDHYIPNFNLSRQQDAEEAFSHLLSALREEISEHCVPTTSSLADLPALPNGRILTAKSSEGENDLQRWSRSFLKPFDGILGSVLLCQSCSFQISLDFQHFHSLHL...

XP_057774953.1
MRRPNRVRMGTKKLSSLIRNGRRINWVSSSGWKISIGVLGAVGIIFASRFRKYLDFNISYQDAASTGVWVVPGLRNLGNNCFLNVVLQTLSSCASFRKYLWEMMEEYGSLSAEEVDDKCGDENLPLFSSLASLVEELCSVRHQRTVLNPRKLMAAMDHYIPNFNLSRQQDAEEAFSHLLSALREEISEHCVPTTSSLADLPALPNGRILTAKSSEGENDLQRWSRSFLKPFDGILGSVLLCQSCSFQISLDFQHFHSLHL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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