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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003537`

染色体: Chr01 坐标: 53991101-53995382 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003537`
名称	SmilChr01G003537
描述	probable serine/threonine-protein kinase At1g54610
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	53991101 - 53995382 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993911`
GeneID	`130993911`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993911`
原始查询	`SmilChr01G003537`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable serine/threonine-protein kinase At1g54610
产物	probable serine/threonine-protein kinase At1g54610
Arabidopsis	`AT1G53050` (AT1G53050) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841739] identity=63; qcov=0.615; evalue=1.34e-147; confidence=high
Rice	`Os01g0367700` (Orysa) - identity=63.9; qcov=0.594; evalue=6.28e-148; confidence=medium
GO	GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0004693 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0008353 (RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity); GO:0032968 (positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993911

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774931.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.20000	`XP_057774931.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057774931.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057774931.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774931.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:53991309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B113,B33,B76,C3
`Chr1:53991508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr1:53991541`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B2,B24,B35,C54
`Chr1:53991555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:53991839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B47,C16,C65,C84
`Chr1:53991877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:53993068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr1:53993107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:53993199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:53993280`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B81
`Chr1:53993280`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B81
`Chr1:53993477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774931.1

545 aa

272

545

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 98-374 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 102-302 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774931.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	98	374	2.6e-67	227.7	Protein kinase domain
`XP_057774931.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	102	302	1.6e-29	103.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918948.1
ATAATGCTAATGCATACAATTCTTGGCATATTTCTTGGTTGGTGGCGGAAAGAAACAAGCATTTTCTTGCATCGCCGGCATCGCTGTCTTCTACCTTCTCTCAACACATTATCATCATCTCATCTACGCTCTACGCCATGCTCTAATAATGAGGCGCCAAAGCTAGTCACTATCAAAATCACACTTAATTAGATTCCTCGGAATAATCGAAAACCATATATACTCGGAGATTCGCCGCGCGCGCGAGAATCATTTAAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993911
ATGGGGTGCGTTCAAACCAAGGGGGCCTCATGCAGTTCCCCGCGGGCGGCGGTGACGCTCGAGAGGCTGAAACAAGACGGCGGCTACGTGAAAGTGGAGAGAGCGGCGGAGGAGAGGAGAATCAGCAGGGAGAGCGAGAGGAGGCATGGCGGCGTGTCGCAGAGGATATCGGCGAAGAAGATCGTGGCCGTTGATGAGACGACGGCCACGGTGGATGGATGGCCGCGGTGGCTGATTGAGAATGTCAAGGAAGATGCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774931.1
MGCVQTKGASCSSPRAAVTLERLKQDGGYVKVERAAEERRISRESERRHGGVSQRISAKKIVAVDETTATVDGWPRWLIENVKEDALAGFIPKSADSYDKLAKVGQGTYSNVYKARDKVTGKIVALKKVRFDTSEPESVKFMAREIIILKKLDHPNIIKLQGIATSRMQYSLYLVFDFMPSDLTKLISRTLTQPQAKTYMLQLLLGLQHCHDKGILHRDIKGSNLLIDKNGVLKIADFGLANFYTTNPLTSRVVTLWYRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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