当前解析结果
SmilChr01G003547| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003547 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003547 |
| 描述 | UDP-rhamnose/UDP-galactose transporter 5-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 54069375 - 54071693 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994609 |
|---|---|
| GeneID | 130994609 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994609 |
| 原始查询 | SmilChr01G003547 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UDP-rhamnose/UDP-galactose transporter 5-like |
| 产物 | UDP-rhamnose/UDP-galactose transporter 5-like |
| Arabidopsis | AT4G09810 (AT4G09810)Nucleotide-sugar transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826570] identity=76.4; qcov=0.92; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os05g0215800- identity=68.9; qcov=1.01; evalue=1.55e-178; confidence=high |
| GO | GO:0005459 (UDP-galactose transmembrane transporter activity); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0015297 (antiporter activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03151 (TPT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994609 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 1.00000 | XP_057775651.1 |
| 2 | Trans-golgi network | Trans-golgi network | 0.20000 | XP_057775651.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057775651.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775651.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775651.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057775651.1PF03151
TPT 23-297 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057775651.1 |
Pfam | PF03151 |
TPT | Family | 23 | 297 | 7e-15 | 55.9 | Triose-phosphate Transporter family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。