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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003553`

染色体: Chr01 坐标: 54173647-54175475 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003553`
名称	SmilChr01G003553
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 8-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	54173647 - 54175475 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994004`
GeneID	`130994004`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994004`
原始查询	`SmilChr01G003553`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase 8-like
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase 8-like
Arabidopsis	`AT5G64790` (AT5G64790) O-Glycosyl hydrolases family 17 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836600] identity=56.9; qcov=0.928; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0792800` (OSJNBb0060J21.19) - identity=56.2; qcov=0.907; evalue=7.69e-177; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00332 (Glyco_hydro_17); PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994004

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057775026.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057775026.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775026.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775026.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775026.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:54173886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C20
`Chr1:54173899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C20
`Chr1:54173966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr1:54174044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr1:54174384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B33,C5
`Chr1:54174420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B126
`Chr1:54174453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:54174468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B28
`Chr1:54174472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,D4
`Chr1:54174486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B75
`Chr1:54174504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr1:54174525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B66,B73,C52,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775026.1

483 aa

242

483

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 27-346 aa PF07983 X8 367-436 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775026.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	27	346	7.2e-64	217.0	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057775026.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	367	436	9.3e-11	42.9	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919043.1
TTACCATTCATTCACATCTCAGTATTAATCTCAACTAAACCATAGACGCACTTCGTGGCGACAAGTTTGATCGATTGATAAAAAATAAAGGATCTCGTGTGTTTTTTCACACACAAAAATCACATGATATTAATTATATTGTCTCGATCGATCGAGTTCTTGTTCCACTCGAGGGCCCCAAGTCCCAACCAACACACATAATTCTCACATAGCTAATGAAGAAACCGACATGGGTTGTGGCGGCCATGGTGGCCGCGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994004
ATGAAGAAACCGACATGGGTTGTGGCGGCCATGGTGGCCGCGGTGGCAGTGGCGCAGGTCGTGGGCGTGGCGGAGGGCCTCGGCGTTAACTGGGGAAATCAGGCGGCCCAAAACCTACATCCTAGAGTCATTGTCCAAATGTTGAAGGACAATAATATTAATAAGGTTAAATTGTTTGATTCCGACGCTTGGGTTGTGAAGCACTTTGCTGGGACAGGAATTGAAGTCATGCTTGGTATTCCTAACCTGCATTTAGCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775026.1
MKKPTWVVAAMVAAVAVAQVVGVAEGLGVNWGNQAAQNLHPRVIVQMLKDNNINKVKLFDSDAWVVKHFAGTGIEVMLGIPNLHLASLADRYKHAKAWVKANLTRHIHEGGVDIKYVAVGNEPFLKAYNGSNLQTTYPALWNIQKAINEAGLGDRIKATIPQNADVYDSGSKGPSNGDFRADIRATMKQIVQFLRDNNAPFVVNVYPFLSLSLNPDFPVEYAFFSGGAQPVQDGGITYTNVLDANLDTLLWSLRKAGCGD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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