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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003554`

染色体: Chr01 坐标: 54178300-54179238 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003554`
名称	SmilChr01G003554
描述	uncharacterized SmilChr01G003554
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	54178300 - 54179238 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010081`
GeneID	`131010081`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010081`
原始查询	`SmilChr01G003554`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=44.6; qcov=0.446; evalue=5.11e-29; confidence=low
Rice	`Os06g0597250` - identity=53.4; qcov=0.984; evalue=5.35e-121; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010081

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057793458.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057793458.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057793458.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057793458.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057793458.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:54178321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C73
`Chr1:54178328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B75
`Chr1:54178397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C20
`Chr1:54178408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B10
`Chr1:54178408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr1:54178426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:54178434`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	47	A10,A23,A24,A8,B1,B100,B101,B107,B108,B109,B110,B120,B125,B139,B16,B17,B18,B26,B29,B38,B39,B4,B41,B6,B63,B7,B70,B72,B74,B77,B8,B83,B87,B90,C20,C23,C28,C30,C35,C36,C45,C73,C8,C9,D10,D5,D8
`Chr1:54178460`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B11,B112,B134,B37,B79,B91,C15,C39,C57,C63,C64,C66,C82,D1
`Chr1:54178468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	121	A1,A10,A18,A19,A21,A23,A24,A25,A3,A8,B1,B100,B101,B102,B103,B105,B107,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B119,B12,B120,B123,B125,B128,B13,B134,B137,B139,B14,B140,B16,B17,B18,B2,B23,B24,B26,B29,B33,B35,B37,B38,B39,B4,B41,B48,B49,B6,B60,B63,B66,B67,B68,B7,B70,B72,B73,B74,B75,B77,B79,B8,B81,B83,B85,B87,B89,B90,B91,B98,C14,C15,C19,C2,C20,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C35,C36,C37,C38,C39,C45,C48,C52,C57,C58,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C73,C74,C75,C76,C78,C8,C82,C83,C86,C9,D1,D10,D11,D2,D5,D7,D8
`Chr1:54178492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A1,A20,B115,B117,B128,B13,B132,B137,B138,B140,B15,B47,B64,B97,C16,C32,C38,C50,C65,C68,C71,C84
`Chr1:54178496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B131,B133,B53
`Chr1:54178497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B133,B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057793458.1

312 aa

156

312

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 10-49 aa PF04827 Plant_tran 118-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057793458.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	10	49	2.6e-19	69.4	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057793458.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	118	307	2.8e-89	298.9	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057937475.1
ATGTATTGTGATAGGGAACGTGAAGTTGGTGAGCAAAGTTTTATGAGTGATTATTTTGTCCCTAATCCAACGTATACTTCGGAGCTCTTCCGGCGTAGATTTTGCATGCAGAAATCATTGTTCCTTCGTATAGTAGATGCTGTTACTGCTAATGACGAATATTTTCAACAGAGACCCGATTGTACGGGTAGGCAAGGCCTTTCACCACTACAAAAATGCACTGGAGCTATGAGGGTGTTGGCTTATGGAACCACAACCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010081
ATGTATTGTGATAGGGAACGTGAAGTTGGTGAGCAAAGTTTTATGAGTGATTATTTTGTCCCTAATCCAACGTATACTTCGGAGCTCTTCCGGCGTAGATTTTGCATGCAGAAATCATTGTTCCTTCGTATAGTAGATGCTGTTACTGCTAATGACGAATATTTTCAACAGAGACCCGATTGTACGGGTAGGCAAGGCCTTTCACCACTACAAAAATGCACTGGAGCTATGAGGGTGTTGGCTTATGGAACCACAACCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057793458.1
MYCDREREVGEQSFMSDYFVPNPTYTSELFRRRFCMQKSLFLRIVDAVTANDEYFQQRPDCTGRQGLSPLQKCTGAMRVLAYGTTTDAVDEYLRMSSTVTRDAVIHFIEGIISCFGDTYLRRPNQQDLQRLLYVGEQRGFPGMIGSIDYMHWELNNCPTAWAGQYAGRSGKPTIILEAVASYDLWIWHAFFGTPGSCNDINVLHRSPVFSDILEGRTPKISYAVNGRRNDRAYYLTDGIYPSWAAFVKTISSSVLRKHEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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