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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003557`

染色体: Chr01 坐标: 54188417-54191066 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003557`
名称	SmilChr01G003557
描述	protein SLOW GREEN 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	54188417 - 54191066 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994169`
GeneID	`130994169`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994169`
原始查询	`SmilChr01G003557`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SLOW GREEN 1, chloroplastic
产物	protein SLOW GREEN 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G39470` (AT4G39470) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830102] identity=50; qcov=0.973; evalue=1.03e-105; confidence=high
Rice	`Os05g0182100` - identity=56.3; qcov=0.642; evalue=8.66e-83; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13174 (TPR_6); PF13432 (TPR_16)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994169

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057775187.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057775187.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057775187.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775187.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775187.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:54188771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B112,B18
`Chr1:54189689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:54189754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:54190662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr1:54190667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:54190782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr1:54190933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775187.1

335 aa

168

335

TPR_16

TPR_6

PF13432 TPR_16 141-196 aa PF13174 TPR_6 170-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775187.1`	Pfam	`PF13432`	TPR_16	Repeat	141	196	5.4e-09	37.0	Tetratricopeptide repeat
`XP_057775187.1`	Pfam	`PF13174`	TPR_6	Repeat	170	195	1.8e-07	32.0	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919204.1
TTAACCCTAAAATAATTTGGATGTATAGTATCTGCAACTGCATATCTCCTCCCTTGGGTTCCCGAGCCGCCATCTCCGCCGCCGATTTCAGAAAGAAAACAAAAAATGGCTGCTTCATCTCTCATCAATTTCTCTCTCTCCTCTCACCATTACAGAAACCACACCCTCAAATCTCCACTCCCCACAATTAGAAGCCCCTCAAAGACCCTGAATTTCAGCTCCTCATCTCCATCTCTCCACCGCCACGCCGCCGCAAAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994169
ATGGCTGCTTCATCTCTCATCAATTTCTCTCTCTCCTCTCACCATTACAGAAACCACACCCTCAAATCTCCACTCCCCACAATTAGAAGCCCCTCAAAGACCCTGAATTTCAGCTCCTCATCTCCATCTCTCCACCGCCACGCCGCCGCAAAATTCCCCATTTCACCTCAACCCATCACCAACCCTTCAATCCCACCCCTCTCCTCACCGCCCCAGAAGAAAATTTTGAGCTTTCTTTTAGCAAAGATAGCAACTTTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775187.1
MAASSLINFSLSSHHYRNHTLKSPLPTIRSPSKTLNFSSSSPSLHRHAAAKFPISPQPITNPSIPPLSSPPQKKILSFLLAKIATLLLGSLIFSGCVKARPCLAEPVQESEVFDNEGEEMCERLLQENPRDIEALKMVVNVKMRRGKSGEAVENVERLIELQPSEMEWRLLQALCYEMMGDLSKAKSLFKNILEQKPLLLRALHGLAMVMHKNQEGAAVFEMLERALEVARRENKVNEERNIRILVAQLHLIKGDLEEAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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