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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003561`

染色体: Chr01 坐标: 54207776-54212073 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003561`
名称	SmilChr01G003561
描述	ABC transporter F family member 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	54207776 - 54212073 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993773`
GeneID	`130993773`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993773`
原始查询	`SmilChr01G003561`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC transporter F family member 5-like
产物	ABC transporter F family member 5-like
Arabidopsis	`AT5G64840` (ABCF5) ral control non-repressible 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836607] identity=75.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0603200` (OsABCF6) - identity=78.4; qcov=0.834; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00005 (ABC_tran); PF12848 (ABC_tran_Xtn)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993773

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057774796.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057774796.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774796.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774796.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774796.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:54208275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:54208443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr1:54208447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B128,B132,B137,B15
`Chr1:54208462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B112
`Chr1:54208474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr1:54208604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B23,D2
`Chr1:54208628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B128,B132,B137,B15
`Chr1:54208962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C79
`Chr1:54209507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr1:54209844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:54210030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,A4
`Chr1:54211039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774796.1

717 aa

358

717

ABC_tran

ABC_tran_Xtn

ABC_tran

PF00005 ABC_tran 138-313 aa PF12848 ABC_tran_Xtn 352-439 aa PF00005 ABC_tran 466-597 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774796.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	138	313	1.3e-56	191.7	ABC transporter
`XP_057774796.1`	Pfam	`PF12848`	ABC_tran_Xtn	Domain	352	439	6.3e-17	62.2	ABC transporter
`XP_057774796.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	466	597	1.3e-56	191.7	ABC transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918813.1
TGCCCTTGGAGTGATGACGTCTTCTCGTCCTCTATAGTAAGCTCCAACTCCTCTGTGAAGCAGAGAGAGAGAGAGAAATTCGCCACAGAGTGATTGTGAGAAACGCAGCTTTCTCTCTCCAAAACCTCTCTCCAACACCACAACAACACTAACTTTTATTGAATACATCAAATTTCACACTCTCCATTACAGCACATTCAAGTCAGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGACTTGGCATCAAAGCTCCAATTTTTGGACCTCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993773
ATGGACTTGGCATCAAAGCTCCAATTTTTGGACCTCCGGTCGACATTCCTCGCCGGCGCAGCACCACTCTCTCACTCCTTCCCGGCGGCTCTCCGTCCCCTCCATTGCTCCTCAACCACCACCATTACCTCCTCGCTCAAAACCACTGCAATCAGCCCTAACAACAATCTCTTCAAAAACCCGCTACGAATTTCCCCAAAATCACAAGCCATCGCCACCGAAGCATCCACCTCGGCGAAGACCCTCGAGGAGGAGAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774796.1
MDLASKLQFLDLRSTFLAGAAPLSHSFPAALRPLHCSSTTTITSSLKTTAISPNNNLFKNPLRISPKSQAIATEASTSAKTLEEEKEDIESLLSESTSEASEISYKRGSNKNSTGASSISSGVRLENVSKSYKGVTVLKDINWEVKKGEKVGLVGVNGAGKTTQMRIIAGLEEPDSGNVIKAKSNMKIAFLSQEFEVVSTRTVKEEFLSAFKEEMEVAERLEKVQNAIEKSVDDLELMGRLLDEFDLLQRRAQAVNLDEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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