当前解析结果
SmilChr01G003566| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003566 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003566 |
| 描述 | stress enhanced protein 2, chloroplastic |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 54242166 - 54243724 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994380 |
|---|---|
| GeneID | 130994380 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994380 |
| 原始查询 | SmilChr01G003566 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | stress enhanced protein 2, chloroplastic |
| 产物 | stress enhanced protein 2%2C chloroplastic |
| Arabidopsis | AT2G21970 (SEP2)stress enhanced protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816733] identity=57.6; qcov=0.914; evalue=5.61e-60; confidence=high |
| Rice | Os04g0639200- identity=49; qcov=1.03; evalue=1.2e-48; confidence=medium |
| GO | GO:0071486 (cellular response to high light intensity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994380 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057775410.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057775410.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 1.00000 | XP_057775410.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057775410.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775410.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:54242459 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B30,C19,D3 |
Chr1:54242585 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr1:54243451 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A20 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。