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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003572`

染色体: Chr01 坐标: 54289064-54290069 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003572`
名称	SmilChr01G003572
描述	acidic endochitinase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	54289064 - 54290069 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994200`
GeneID	`130994200`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994200`
原始查询	`SmilChr01G003572`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	acidic endochitinase-like
产物	acidic endochitinase-like
Arabidopsis	`AT5G24090` (CHIA) chitinase A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832474] identity=60.3; qcov=1; evalue=1.87e-131; confidence=high
Rice	`Os01g0860500` (C10501) - identity=67.5; qcov=0.929; evalue=2.32e-140; confidence=high
GO	GO:0004568 (chitinase activity); GO:0005576 (extracellular region); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00704 (Glyco_hydro_18)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994200

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057775218.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775218.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775218.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775218.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775218.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:54289189`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr1:54289204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr1:54289327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr1:54289329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:54289341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C18
`Chr1:54289508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr1:54289552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr1:54289645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:54289650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B75
`Chr1:54289762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B124,B23,B84,D2
`Chr1:54289823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr1:54289830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775218.1

295 aa

148

295

Glyco_hydro_18

PF00704 Glyco_hydro_18 26-245 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775218.1`	Pfam	`PF00704`	Glyco_hydro_18	Domain	26	245	6.2e-24	86.0	Glycosyl hydrolases family 18

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919235.1
TAAGCTTGACTCGAATCAAAATTCAAAATCATGGCCTTTCAATCACGAATCTCACTAGCGTTACTTATCTCCACATGTCTATTTTTTTCACCCTCTCATGCAGGCAAAATAGCCATCTATTGGGGCCAAAATGGGGGAGAGGGCACGTTGGCACAAACTTGTGCCTCGGGAAATTACAAATTTGTCAACCTAGCATTTCTTGCAACATTCGGCAACGGGCAAACTCCGGCGATCAATCTCGCCGGCCACTGTGACCCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994200
ATGGCCTTTCAATCACGAATCTCACTAGCGTTACTTATCTCCACATGTCTATTTTTTTCACCCTCTCATGCAGGCAAAATAGCCATCTATTGGGGCCAAAATGGGGGAGAGGGCACGTTGGCACAAACTTGTGCCTCGGGAAATTACAAATTTGTCAACCTAGCATTTCTTGCAACATTCGGCAACGGGCAAACTCCGGCGATCAATCTCGCCGGCCACTGTGACCCCACCGCCGGTGGCTGCACCGGCCTCAGCTCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775218.1
MAFQSRISLALLISTCLFFSPSHAGKIAIYWGQNGGEGTLAQTCASGNYKFVNLAFLATFGNGQTPAINLAGHCDPTAGGCTGLSSDIKSCQAKGVKVLLSIGGAAGSYYLTSAQDARQVATYLWDNFLGGSSSTRPLGDAVLDGVDFDIEGGTNQHWDDLARYLSAYSKRGKKVYLSAAPQCPFPDAWIGEALQTGLFDYVWVQFYNNPPCQYSSGMANLEAAWKQWSSIKATEIFLGLPASASAAGSGFIPAGDLTSQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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