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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003585`

染色体: Chr01 坐标: 54423051-54425934 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003585`
名称	SmilChr01G003585
描述	transcription termination factor MTERF15, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	54423051 - 54425934 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994077`
GeneID	`130994077`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994077`
原始查询	`SmilChr01G003585`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription termination factor MTERF15, mitochondrial-like
产物	transcription termination factor MTERF15%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G64950` (AT5G64950) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836619] identity=37.9; qcov=0.792; evalue=1.55e-61; confidence=medium
Rice	`Os02g0749800` - identity=27.9; qcov=0.836; evalue=1.22e-39; confidence=low
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	-
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994077

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057775096.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775096.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775096.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775096.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775096.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:54424444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr1:54424458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C60
`Chr1:54424883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr1:54424955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,C20,C72
`Chr1:54424983`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A25,B101,B108,B117,B121,B44,B57,B93,C18,C46,C49,C75,C83
`Chr1:54425008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr1:54425023`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B140
`Chr1:54425023`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B140
`Chr1:54425074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B113,B92,C79
`Chr1:54425148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C10
`Chr1:54425484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775096.1

403 aa

202

403

mTERF

PF02536 mTERF 92-175 aa PF02536 mTERF 185-373 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775096.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	92	175	1.2e-38	133.5	mTERF
`XP_057775096.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	185	373	1.2e-38	133.5	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919113.1
GGATAGACTACACAATGATATCCAATTGTTTATTGTTTATCTATACATGTCCACTTTTATGATTAAATAAATTAGATTACTTTACAAACATCAGTAACTCAAATATAATGAAGATGAATAGGTAGGACGAGAGGTGTGAGAAATTAAGAATAGATATTGGTACGGCGGCGTTGCTGTGTTTTGCTCTCCTGCCACCTCCCCTACGGCGGCGCCGCTCATATCCGGCAGCCAACAGGAAACAATGAAGAAACTGATGCAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994077
ATGAAGAAACTGATGCAGGCTTTCCAAATTAAATCTATTTTCTTACCTTCACCATCACAAAATTATCTCTCCAGCCCTAGCAAGTCACTTATCTCATGGATTACGGCTTACTCTACATTGTCTCAGAAGAAGGCCATTTCTCCCAAACTAAATGTGGAAAACTCTATTTTAGCCGATTACCTGGTCGGCTCCTTAAAACTCTCCAAAAATAGAGCCCTTTCAATCTCAAGCAAATTACACTGCCAAACTCTTGAAAAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775096.1
MKKLMQAFQIKSIFLPSPSQNYLSSPSKSLISWITAYSTLSQKKAISPKLNVENSILADYLVGSLKLSKNRALSISSKLHCQTLEKPEQTVRFFRGLGFSDAHIRAIVNSVPRLLLSDTEKTLKPKVEFFQELGLSGPLLGTFISRTPCILYCSVDRCLNPRVDLIRKIIATDGRTRSKESVNDNLFRIITRCGRIILARHTLEDNVAYLKSCGVVGSQLSSLLVRLPRIFTLRYDKLEEVVSRALAMNFTMGSRMLVHG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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